GWAS基因检测.docVIP

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GWAS基因检测 GWAS基因检测可以在全基因组范围内进行高通量的大规模筛选,可以发现单基因检测很难发现的遗传变异,检测结果更准确,做到真正的疾病预防:早发现、早预防、早治疗。 国际最新的GWAS全基因组基因检测技术,选取多个疾病密切相关的的基因位点,对SNP进行全面的检测,对易感疾病的判断更敏锐、准确度更高。GWAS全基因组检测技术具体操作如下: 收集对照组和患者样本(组织、血液等),提取DNA 进行全基因组单核苷酸多态性(SNP)芯片扫描,获得数据信息 采用关联分析,筛选与疾病关联的序列变异的研究 该方法试图通过疾病的变异基因和单核苷酸多态性,研究确定疾病发病易感区域和相关基因,寻找疾病的标记物,进行早期诊断和有效的个体化治疗,进行特异性预防措施。 GWAS与以往检测的区别和优点: 差异性 GWAS基因检测 常规基因检测 常规体检 科学依据 病例对照研究,全基因组扫描,海量文献meta分析 少量文献,病例对照数相对较少 非基因位点,为免疫生化指标 检测方法 全基因组芯片,近百万基因位点 普通分子生物学方法为主 常规生化免疫方法 检测基因数量 高通量,目前报道已知与该疾病相关的几乎所有基因位点 少量或部分基因位点 低通量,不涉及基因,常规指标 用途 评估潜在的发病风险,以便提前干预 评估潜在的发病风险,以前提前干预 分析是否已经患病,发现时实际已经患病,无法提前预防 结果解读 提供相对普通人群发病风险增高的具体倍数,指导价值高 通常只提示高或低风险无具体数值,指导价值欠佳 提示与某类疾病相关 现在针对我们平台所做的肿瘤套餐介绍如下:我们在GWAS数据库中提取了针对于亚洲人群(主要是日本、韩国、中国、马来西亚等人种)研究的肿瘤相关文献,挑选各个肿瘤的相关疾病位点进行研究。现针对各个肿瘤介绍其相关位点信息: 胃癌基因检测的相关位点: 位置 检测位点 基因型 相对风险 人群频数 病例/对照 相关参考文献 MCU1 DAGC01 AG 0.67 0.279 1681:1858 [1]、[2]、[3]、[4] PLCE1 DAGC02 AG 1.38 0.422 1681:1858 PSCA DAGC03 AG 1.40 0.442 1043:1082 ZBTB20 DAGC04 CG 0.77 0.209 2444:3245 PRKAA1 DAGC05 TT 0.68 0.628 2444:3245 参考文献: 1. Zhang H, Jin G, Li H, et al. Genetic variants at 1q22 and 10q23 reproducibly associated with gastric cancer susceptibility in a Chinese population. Carcinogenesis. 2011; 32(6): 848-52. 2. Wang N, Zhou R, Wang C, et al. A polymorphism of the interleukin-8 gene and cancer risk: a HuGE review and meta-analysis based on 42 case-control studies. Mol Biol Rep. 2012; 39(3): 2831-41. 3. Lu Y, Chen J, Ding Y,et al. Genetic variation of PSCA gene is associated with the risk of both diffuse- and intestinal-type gastric cancer in a Chinese population. Int J Cancer. 2010; 127(9): 2183-9. 4. Shi Y, Hu Z, Wu C, et al. A genome-wide association study identifies new susceptibility loci for non-cardia gastric cancer at 3q13.31 and 5p13.1. Nat Genet. 2011; 43(12): 1215-8. 、鼻咽癌基因检测的相关位点: 位置 检测位点 基因型 相对风险 人群频数 病例/对照 相关文献 HLA-A DANC01 AC 0.58 0.537 900:1800 HLA-F DANC02 AG 1.2 0.372 900:1800 、肺癌基因检测的相关位点: 位置 检测位点 基因型 相对风险 人群频数 病例/对照

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