DNA序列中基因的预测可利用NCBIORFfinder.pptVIP

DNA序列中基因的预测可利用NCBIORFfinder.ppt

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DNA序列中基因的預測(可利用NCBI ORF finder、GENEMARK、Easy gene) ↓ BLAST搜尋比對所轉譯的胺基酸序列 ↓ 選取15-20個序列序列 ↓ Display setting--FASTA text ↓ 複製到記事本中 ↓ 修改呈現的文字內容 ↓ 將記事本中文字複製,利用DDBJ中的 Clustal W(多序列比對分析)排比分析 (或將序列貼到SDSC中,再以Clustal W 排序) ↓ 下載比對後的檔案(*.dnd, *.ph),以treeview軟體打開檔案,選第四種格式 ↓ 選save as graphic,存成*.emf格式 ↓ 打開powerpoint、插入→圖片→從檔案(選剛剛儲存的檔案) 在圖片點一下,按右鍵→群組物件→取消群組 (將圖形有文字的部分拉大至接近整個版面) ↓ 再按一次右鍵→群組物件→取消群組 (不要隨意拉大任一條線,需整體調整,以免演化樹的結果失真,與原圖比較修正消失的最左邊連接線) ↓ 找出圖形修改工具,逐一修改文字(18或20的大小)、線條顏色大小 ↓ 將線與文字位置對齊、形狀跑掉的圖形要回去參照treeview軟體的原始檔案,修改成一樣,放大版面修改會較精確些 * *

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