gaussview使用简介.pptVIP

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GaussView使用简介 Gview的界面及主要功能键的介绍 常用功能键的介绍 以构建一个间氟苯乙烷分子并从Gview里递交计算为例来说明 结算结果可视化的实现 选择完毕后,点Submit即可递交计算。有时由于安装的原因Gview无法与Gauss建立关联,就不能直接从Gview里递交计算。这时可以在Gview里保存用于Gauss计算的输入文件,然后从Gauss里调出文件进行计算。 1.几何构型 2.分子振动 3.轨道 4.电荷密度 5. 静电势 选择File,打开一个已经正常计算完的结果,然后选择Results,就可以出现以下选项 见下图 主菜单 选择Vibrations选项,就可以直接查看分子的振动模式(见下图) * * Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示高斯计算的结果除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围(详见下图) GVIEW的界面 第一行为菜单栏: File:主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件 Save Image 将当前文件保存为图片格式 Preferences。可以在里面改变Gview默认的各种显示的设置。 Edit: 在这里可以完成对分子的剪贴,拷贝,删除 和 抓图等。 Atom List,显示当前分子的内坐标,笛卡儿坐标,分数坐标等。 Point Group 可以显示当前分子的点群及可能有的点群。 PBC显示晶体文件(可以将CIF文件转换为图形,在点PBC按钮后所给并的对话框中根据选项调节具体显示的格式。 Mos用于显示分子轨道(只有检查点文件,此选项才能给出分子轨道图。 Symmetrize,对当前体系进行对称性控制。 View 这里面的选项都是于分子的显示有关的,如显示氢原子,显示键,显示元素符号,显示坐标轴等 Calculalte: 可从Gview中直接向高斯提交计算。这是Gview作为高斯软件配套功能的重要体现。从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化,能量或频率等);计算方法Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等,还可以选定组);Title(对所要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查点文件命名,还可以在此用RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General,Guess,(这两个选项主要是给出体系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测);NBO(可在此设定NBO计算),PBC(可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在此设定溶液中的计算,除了选择溶剂外,还要选择模拟溶剂的理论模型) Result :显示计算的结果,包括电荷,静电势表示的表面,振动,频率,核磁,势能面扫描,优化等。注意有些结果只能 用检查点文件才能显示。 (1)双击Gview图标, 打开Gview ,下图就是Gview打开后的窗口 打开Gview ,下图就是Gview打开后的窗口 (2).双击窗口中 图标,得到如下窗口里面有常用的环状官能团。选中苯环(单击即可选中) (3).在当前工作窗口(打开Gview时程序自动打开一个工作窗口,如下图)也可通过File-new 路径 新建一个工作窗口 在这个窗口中点鼠标左键窗口中就会出现苯分子,见下图 将鼠标放在分子上,按左键左右或前后移动,可以调节分子的角度将鼠标放在分子上,前后移动,可以将分子放大或缩小Shift+Alt+鼠标左键组合可以在窗口内平移分子 当工作窗口内有多个分子时[在构建大的分子时,这种情况很容易出现]这时可用以下命令可以用Shift+Alt+鼠标左键组合移动想要移动的分子,以调节各个分子间的距离可以用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度,以调节各个分子间的角度。Ctrl+Alt+鼠标左键这个组合常和[将鼠标左键放在分子上,左右或前后移动,可以调节分子的角度]这个功能连用。 (4).双击Gview界面上的 图标。出现以下窗口点击氟的元素符号“F”,就选中氟原子。 (5).回到工作窗口在苯环上的任一个H上单击左键,将H置换成F。 但要注意此时仅是元素符号发生了改变,C-F间的距离仍是C-H键的距离。需要用建长工具进行调整。单击Gview界面上 图标。 然后再点击工作窗口中的C原子和F原子,看到被选中的两个原子于周围的原子再亮度上有差异此时会出现下面的窗口 根据C-F键的长度在 0.675和2.700之间的方框内进行C-F键的调整。完毕后点击OK即可。 (6).双击Gview界面上的 图标,出现以下窗口这是

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