第一章标准建立的背景和意义-中国有色金属标准质量信息网.doc

《嗜酸氧化亚铁硫杆菌及其活性的基因芯片检测方法》 国家标准编制说明 1、 工作简况 微生物冶金通过利用以矿物为能源的微生物的作用，氧化分解矿物使金属离子进入溶液，进一步分离、提取金属，具有流程短、成本低、环境友好和低污染等特点，特别是微生物冶金技术能处理低品位、复杂、难处理的矿产资源。低品位、复杂硫化矿微生物冶金速度慢、浸出率低是国际上未能解决的难题，而其根源在于缺少专属性、环境适应性好的菌种。 嗜酸氧化亚铁硫杆菌（以下简称A. f菌）属于原核生物门、细菌纲、硫化细菌科、硫杆菌属，革兰氏阴性,有鞭毛。该菌好氧嗜酸、化能自养, 能氧化金属硫化物，将Fe2+氧化成Fe3+，将还原态的硫氧化成S042＋，是生物冶金中最常用的菌种，同时也是研究最多的浸矿微生物目前完成全基因 化学机械抛光纳米新材料制备技术及应用，科技部国际合作项目 硫化矿浸出专属菌种对原生矿浸出作用机理与实践研究，国家自然科学基金项目 铜锌硫化矿细菌浸出的微生物学机制研究，教育部高等院校博士点基金 低品位矿微生物浸出理论与实践研究，教育部高等院校博士点基金 在生物冶金相关领域目前已获得如下主要成果与奖励： 硫化矿电位调控浮选理论与实践，国家科技进步一等奖(J-210-1-02-R05)，2000年 低品位铜矿和锌矿复合催化剂和改良菌种生物浸出新技术，湖南省科技进步一等奖，2002年 我国铜矿生物提取专属菌种选育及提铜产业化应用，教育部中国高校十大科技进展，2002年 德兴低品位硫化铜矿细菌浸出提铜工业化实验研究，国家有色金属工业局科技进步二等奖（国色规字(1999)347-30），1999年 硫化矿浸出专属菌种的筛选和遗传改良技术，中国有色金属工业科技进步二等奖，2002年 专利：一种浸矿用菌种培育方法，专利号CN 1350058A 专利：锌矿石细菌浸出-萃取-电积提锌新工艺，专利号 CN 1360065A 2、 编制原则、主要技术指标确定依据 2.1. 筛选了大量不同活性的A.f 菌 从广西大厂、云南东川、思茅、广东大宝山、梅州、湖北大冶、江西德兴、甘肃白银、湖南浏阳其宝山等9个矿区采集的32份样品中分离得到了氧化亚铁硫杆菌32株。同时发现，不同A.f菌株在氧化活性和抗性等方面的差异导致其浸矿效果不同。共筛选到高活性菌5株，低活性菌5株，其它中等活性菌20株。 2.2. 通过国际合作获得了A.f菌全序列测定 2000年以来，中南大学和美国基因组研究所(The Institute of Genome Research,简称TIGR)合作进行了模式嗜酸氧化亚铁硫杆菌ATCC 23270的研究，通过全序列基因组测序鉴定出3217个基因。我们与TIGR达成共同使用该信息的协议。 2.3 构建了A.f 菌全基因组基因芯片 根据A.f菌全部3217个基因序列信息，应用合作单位美国橡树岭国家实验室的同事开发的设计探针，利用本实验室的生物芯片点样仪，通过接触式点样法制备了A.f 菌全基因组基因芯片。 2.4 从基因型分析确定A. f 菌芯片鉴定标准 13株不同A.f菌基因组DNA与芯片杂交发现，3217个基因中的967个为不同的菌株所特有，其余的2250个（2250/3217=70％）为所有.A.f菌共有，其具体分布如下： 表1. A.f菌菌株共有基因与株系特异性基因的分类表 功 能 共有基因数（个） 特有基因数（个） 生物因子的合成，辅基基团，载体 108 80 中间代谢 70 55 可移动的和染色体外元素功能 99 38 氨基酸合成 85 60 细胞膜 249 238 细胞处理 169 125 破坏阅读框 51 36 DNA代谢 141 123 能量代谢 212 186 脂肪酸和磷酸代谢 32 26 推断的保守蛋白质 358 172 推断的蛋白质 757 450 Protein fate 119 92 蛋白质的合成 122 103 嘌呤 嘧啶 核苷 核苷酸 56 43 调节作用 123 118 信号转导 36 32 转录 41 30 转运与结合蛋白 247 185 未知功能 192 148 据此，我们确定待检菌与模式菌有70%以上基因相同作为A.f 菌判决标准。 2.5 A. f 菌活性基因水平标准 将所获得5株高活性A.f菌基因组DNA 与所构建的基因芯片杂交，发现它们共同含有320个与亚铁和硫氧化以及抗性等功能有关的基因，其具体分布如下：（1）中间代谢（硫、氮代谢）：24/70；（2）胞壁质、肽聚糖、多聚糖和脂多糖的生物合成与降解：33/122；（3）解毒：15/37；（4）DNA代谢：36/141；（5）能量代谢：85/212；（6）脂肪酸和磷酸代谢：5/32；（7）蛋白质的合成：26/