an98在有机化学教学中的应用Gaussi.PDFVIP

第 20卷 　第 2期 2005年 4 月 Gaussian 98在有机化学教学中的应用 王后雄 　谭英 (华中师范大学化学学院　武汉 　430079) 　　摘要 　Gau ssian 98软件可以展示反应的途径及反应机理 ,能够计算反应的相关数据 ,尤其是 该软件在有机化学教学中的应用 ,更能显示出在教学中的应用优势 。 　　随着课程教材改革的全面推行和逐步深入 ,教学手段的现代化对实施素质教育、提高课堂 教学效率有重要作用 。计算机辅助教学 已逐步深入到化学教学中[ 1 ] , 大量的化学软件及 PowerPo in t, A u thorware, F la sh , Photo shop [ 2 ] 等都应用于 CA I课件制作中。本文介绍的 Gau ssian 98软件是一个量子化学综合软件包 ,可执行各种不同精度和理论层次的分子轨道计算 ,为 ( ) ( ) H artreeFock 水平从头算 H F ,MCSCF法 ,密度泛函理论 D ET 以及多种半经验量子化学方 法 。主要计算项 目包括计算分子的能量 ,反应过渡态的能量和几何结构 ,震动频率分析 ,键能 与化学反应能 ,化学反应途径 , 电荷分布等 。 ( ) 　　下面简述 Gau ssian 98 英文版 量子化学软件在有机化学教学中的应用 。 1　功能及使用方法 1. 1　分子结构式的绘制 　　基本方法 :在程序界面元素周期表的位置处找到所需的元素 ,单击即可调入该元素与氢元 素的化合物 ,而后进行该元素键型的选择及特殊基团的选择 ,重新构建分子直至构建为所需分 子 ;选定要编辑的原子后 ,再对原子之间的键长 ,键角或者二面角进行选定 ,输入所需要的键 长 ,键角或二面角值 。 1. 2　分子结构的几何优化 　　绘制好分子结构后 ,就可以将其用于 Calcu late 中的 Gau ssian进行运算 ,在 Rou te Section行 中输入计算能量所需的方法 ,选择 Op t为关键词 , 即可提交进行分子优化 ,得到该分子的最稳 定结构 。 1. 3　振动频率的计算 　　将分子结构投到 Calcu late 中的 Gau ssian 后 ,按上述方法选择计算所需的方法 ,将关键词 选择为 Op t + freq,即可进行频率计算 。通过频率分析可以确定该分子为稳定态还是过渡态 。 ( ) 如果频率振动中有一个负频 虚频 ,就可以证明这种结构是一个过渡态 。如果全为正频就表 明这个结构是一个稳定态 。 1. 4　寻找过渡态 　　对一个化学反应中的反应物和产物进行几何优化和频率计算 ,确定它们均为稳定态之后 , 36 ( ) 再假想一个比较可能的构型 符合反应机理 进行过渡态优化计算 。按上述方法选择所需计 ( ) ( ) 算的基组 ,关键词选择为 Op t = TS, CalcFC ,并选定 Carte sian 标准坐标 。 1. 5　IRC ( 内禀反应坐标 )计算 　　将优化好的过渡态重新投到 Calcu late 中的 Gau ssian 中 ,关键词选择为 IRC = ( Forword, ) ( ) step size = n 或者 IRC = R everse, step size = n , n = 1, 2 , 3 ……代表优化进行到第 n 个点 。其默 认值为 6,表示优化进行到第 6个点 。按上述方法选择所需计算的方法 , 即可提交进行 IRC计 算 。通过 IRC计算 ,可以寻找真正的反应途径 ,即能量最低的反应途径 。 　　通过以上方法也可以得到各种分子的能量 、振动频率 、