一、数量性状表型值的剖分.ppt

第三章：数量遗传学原理 基本内容 一、数量性状表型值的剖分 1、 表型值分解 表型值的效应分解：性状表现由遗传因素决定、并受环境影响， 表型值 = 基因型值+环境偏差 P = G + E. P 为个体表现型值(phenotypic value)(也即性状观察值)； G 为个体基因型(效应)值(genetic value)，也称遗传效应值； E 为环境效应值(environment value)，当无基因型与环境互作时，E=e为随机误差(random error)符合正态分布N(0,σ2)。 1、重复力的定义 五、选择效率 五、选择效率 说明：由于表型的效应包含了遗传与环境两方面因素的影响，应此几乎所有的情况下选择差都大于遗传增益。 五、选择效率 3、适应性与适合度 （1）进化论中的适者生存，也称适应性 （2）描述适应性的指标：适合度 W 连续型：马尔萨斯 适合度参数：a 指产生有效后代的数量与原群体数量的比值 离散型： W * * 2008 数量性状表型值的剖分 1 遗传力 2 重复力 3 4 近亲繁殖和杂种优势 2、表型方差分量分解 表型方差分量分解。根据性状效应值分解可得： VP = VG + VE 此时基因型与环境间无互作效应，其中： VP 为群体表型方差(phenotypic variance)(由性状资料计算)； VG 为群体基因型差异所引起的变异方差，称为遗传方差(genetic variance)，也称为基因型方差； VE 为环境因素所引起的变异方差，称为环境方差(environ-ment variance)；无互作时为机误方差(Ve, error variance). 一、数量性状表型值的剖分 3、遗传效应分解 一、数量性状表型值的剖分 对于多基因控制数量性状，分离群体中个体间基因型差异及其所引起的遗传效应可分为三类： 加性效应(A, additive effect)：由基因间(等位基因与非等位基因间)累加效应所导致的个体间遗传效应差异； 显性效应(D, dominance effect)：等位基因间相互作用导致的个体间遗传效应差异； 上位性效应(I, epitasis effect)：非等位基因间相互作用所导致的个体间遗传效应差异。 因此有： G = A + D + I； P = A + D + I + E. 其中，D 与 I 不具有可加性，合称为非加性效应。 由于群体遗传变异有三种类型，其遗传方差也可进而分解为三种方差分量： 加性方差(VA)：个体间加性效应差异导致的群体变异方差；显性方差(VD)：个体间显性效应差异导致的群体变异方差；上位性方差(VI)：上位性效应差异导致的群体变异方差。 因此有： VG = VA + VD + VI； VP = VA + VD + VI + VE. 此时，VD + VI 为非加性方差。 一、数量性状表型值的剖分 4、遗传方差分解 一、数量性状表型值的剖分 : 基因型值 ：群体该性状总平均值 : 环境和其他因素对数量性状的影响 4、数量性状表型值描述 一、数量性状表型值的剖分 4、表型相似性 （1）Pearson 相关系数 x,y分别表示两个表型向量 一、数量性状表型值的剖分 （2）数量性状回归方程 基因型值x：AA、Aa 、aa；0、1、2 表型值y：连续值 假设检验： 3、欧氏距离建立同胞对回归方程 一、数量性状表型值的剖分 IBD/IBS 1/3 1/2 1/2 1/3 IBD=0 1/1 1/3 1/2 1/3 IBD=1 1/2 1/2 1/2 1/3 IBD=2 血缘一致（identical by descent,IBD）： 指的是子代中共有的一段DNA区域或共有的等位基因来源于 一个共同的祖先。 一、数量性状表型值的剖分 基因型相似性：IBD 表型相似性：y 回归方程： 二.遗传力 遗传力(heritability)：遗传变异占总变异(表型变异)的比率，用以度量遗传因素与环境因素对性状形成的影响程度，是对杂种后代性状进行选择的重要指标。（均为正值） 1、遗传力的定义 广义遗传力(hB2)：遗传方差占总方差(表型方差)的比率； VP = VG + VE HB2 = VG/ VG + VE 狭义遗传力(hN2)：加性方差占总方差的比率。 h2 = VA / VP或 h2 = σA2 / σP2 二.遗传力 VG = VA + VD + VI； VP = VA + VD + VI + VE. 表型方差分解： 2 遗传力的意义与两种