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(五) PCR的反应过程 1、PCR的反应步骤 PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤── 变性、复性和延伸 ①变性(模板DNA解旋) 模板DNA经加热至900C以上。一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离, 使成为单链,以便于它与引物结合, 为下轮反应作准备 2、循环过程 靶序列 靶序列 PCR 循环第一步 :加热变性 ②复性(退火) 模板DNA经加热变性成单链后,温度降到500C左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合 靶序列 靶序列 引物 Ⅰ 引物 Ⅱ 5’ 3’ 5’ 5’ 3’ 5’ 3’ 3’ PCR 循环第二步 :引物与靶序列退火 ③延伸 DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的DNA链 靶序列 靶序列 引物Ⅰ 引物Ⅱ 5’ 3’ 5’ 5’ 3’ 5’ 3’ 3’ Taq DNA 聚合酶 PCR 循环第三步 :引物延伸 靶序列 靶序列 第1个 PCR 循环完成后 :得到两个拷贝的靶序列 3、30次循环后靶序列扩增的数量 8 3 1,073,741,824 30 1,048,576 20 4 2 2 1 DNA数量 循环 次数 4、PCR 循环的结果 ② DNA聚合酶只能特异性地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数扩增 ①从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸 PCR反应条件: ①稳定的缓冲液环境 ②DNA模板 ③分别与两条模板链相结合的两种引物 ④A、T、G、C四种脱氧核苷酸 ⑤耐热的DNA聚合酶,一般用TaqDNA聚合酶 ⑥能严格控制温度变化的温控设备 二、 PCR 的实验操作 1、PCR仪 (一)设备及用具 实质上一台能够自动调控温度的仪器 2、微量离心管 一种薄壁塑料管,总容积为0.5ml 3、微量移液器 用于定量转移PCR配方中的液体,其上 的一次性吸液枪头用一次更换一次 PCR仪 微量移液器 微 量 离 心 管 离心管 1、准备 2、移液 (二)实验操作步骤 按照PCR反应体系的配方将所需用的试剂摆放在实验桌上 用微量移液器按照PCR反应体系配方往微量离心管里面加入各种试剂 多聚酶链式反应扩增DNA片断 一、基础知识 (一)DNA分子的结构 C、H、O、N、P 1、组成元素 脱氧核苷酸 2、基本单位 3、脱氧核苷酸结构 脱氧 核苷酸 脱氧 核苷 磷酸 脱氧核糖 含氮碱基 嘌呤 嘧啶 腺嘌呤(A) 鸟嘌呤(G) 胞嘧啶(C) 胸腺嘧啶(T) 一个核苷酸上的磷酸基团上的“-OH”和另一个核苷酸分子的第三位碳原子上的羟基之间失去一分子水,形成磷酸二酯键,即在相邻的两个脱氧核苷酸的3’和5’碳原子之间形成磷酸二酯键。数量庞大的四种脱氧核苷酸通过3’、5’磷酸二酯键彼此连接起来形成脱氧核苷酸链。通常将DNA的羟基“-OH”末端称为3’端,而磷酸基团的末端称为5’端 4、多脱氧核苷酸链得形成 脱氧核苷酸结构式 3’胞嘧啶脱氧核苷酸 5、DNA分子的双螺旋结构 ① DNA分子是由两条反向平行的(即一条链为3’-5’,另一条链为5’ -3’ )脱氧核苷酸长链盘旋而成的规则双螺旋结构 ②脱氧核糖与磷酸交替连结,排列在外侧,构成基本骨架;碱基排列在链的内侧 ③两条链上的碱基通过氢键连结起来,形成碱基对。碱基对的组成有特定的规律:即腺嘌呤一定与胸腺嘧啶配对,鸟嘌呤一定同胞嘧啶配对 6、利用碱基互补配对规律的计算 规律一:DNA双链中的两条互补链的碱基相等,任意两个互补的碱基之和相等即A=T,G=C。任意两个不互补的碱基之和恒等,占碱基总数的50%。 即:A+G=T+C=A+C=T+G=50%, (A+G)/(T+C)=(A+C)/(G+T)=(T+C)/(A+G)=1 规律二:在DNA双链中的一条单链(A+G)/(T+C)的值与另一条互补链的 (A+G) /(T+C)的值互为倒数关系 规律三:DNA双链中,一条单链的(A+T)/(G+C)的值与另一条互补链的(A+T)/(G+C)的值是相等的,也与整个DNA分子中的(A+T)/(G+C)的值相等 (二)DNA分子的特性 1、稳定性 在DNA分子双螺旋结构的内侧,通过氢键形成的碱基对,使两条脱氧核苷酸长链稳固的并联起来 例题:甲DNA分子中,A和T占25%,G和C占75%,乙DNA分子中,G和C占25%, A和T占 75%,哪一个稳定? 答:甲DNA分子比乙DNA分子稳定。因为A与T之间形成两个氢键,在G和C之间形成三个氢键,三个氢键比两个氢键稳定,所以在DNA分子中
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