全国数学建模研究生C题.docVIP

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全国数学建模研究生C题

2010年全国研究生数学建模竞赛C题 神经元的形态分类和识别 大脑是生物体内结构和功能最复杂的组织,其中包含上千亿个神经细胞(神经元)。人类脑计划(Human Brain Project, HBP)(1a) 鼠中海马的CA1锥体神经元. (1b) 关键位置: D, 树突; S, 胞体; AH, 轴突的开始阶段轴丘; A,; T,轴突末端. 树突的类型: e, 单个树突的等价圆柱体; a, 树突顶端; b, 树突基端; o, 树突倾斜. : (p)最近端, (m) 中间端, 和 (d) 最远端-相对细胞胞体. (1c)神经元局部形态的简单几何特征:D树干直径,T顶端直径,L树干长度,△A树干锥度,R分支比例(前后分支的长度关系),ν分支幂律(前后分支的直径关系),α分支角度. 对神经元特性的认识,最基本问题是神经元的分类。目前,关于神经元的简单分类法主要有:(1)根据突起的多少可将神经元分为多极神经元;双极神经元和单极神经元。(2)根据神经元的功能又可分为主神经元,感觉神经元,运动神经元和中间神经元等。主神经元的主要功能是输出神经回路的信息。例如大脑皮层的锥体神经元,小脑皮层中的普肯野神经元等。感觉神经元,它们接受刺激并将之转变为神经冲动。中间神经元,是介于感觉神经元与运动神经元之间起联络作用的。运动神经元,它们将中枢发出的冲动传导到肌肉等活动器官。不同组织位置,中间神经元的类别和形态,变化很大。动物越进化,中间神经元越多,构成的中枢神经系统的网络越复杂。 如何识别区分不同类别的神经元,这个问题目前科学上仍没有解决。生物解剖区别神经元主要通过几何形态和电位发放两个因素。神经元的几何形态主要通过染色技术得到,电位发放通过微电极穿刺胞内记录得到。利用神经元的电位发放模式区分神经元的类别比较复杂,主要涉及神经元的Hodgkin-Huxley模型和Rall 电缆模型的离散形式(神经元的房室模型)。本问题只考虑神经元的几何形态,研究如何利用神经元的空间几何特征,通过数学建模给出神经元的一个空间形态分类方法,将神经元根据几何形态比较准确地分类识别。 神经元的空间几何形态的研究是人类脑计划中一个重要项目, NeuroMorpho.Org包含大量神经元的几何形态数据等,现在仍然在不断增加,在那里你们可以得到大量的神经元空间形态数据,例如附录A和附录C。对于神经元几何形态的特征研究这个热点问题,不同专家侧重用不同的指标去刻画神经元的形态特征,例如图1、下面给出的神经元的粗略空间刻画以及附录A和附录C用标准的 A.SWC 格式给出的刻画。你们需要完成的任务是: 利用附录A中和附录C样本神经元的空间几何数据,寻找出附录C中5类神经元的几何特征(中间神经元可以又细分3类),给出一个神经元空间形态分类的方法。 附录B另外有20个神经元形态数据,能否判定它们属于什么类型的神经元。在给出的数据中,是否有必要引入或定义新的神经元名称。 神经元的形态复杂多样,神经元的识别分类问题至今仍没有解决,你们是否可以提出一个神经元分类方法,将所有神经元按几何特征分类。你们能否给生物学家为神经元的命名提出建议(附录A和附录C的神经元是比较重要的类别,实际应该有很多其他类别)。 按照你们的神经元形态分类方法,能否确定在不同动物神经系统中同一类神经元的形态特征有区别吗?例如,附件A中有猪的普肯野神经元和鼠的普肯野神经元,它们的特征有区别吗? 神经元的实际形态是随着时间的流逝,树突和轴突不断地生长而发生变化的,你们能预测神经元形态的生长变化吗?这些形态变化对你们确定的几何形态特征有什么影响。 参考1,神经元数据来源:/neuroMorpho/index.jsp 参考2,神经元数据来源: /NeuronDB/ndbRegions.asp?sr=1 参考3,神经元数据来源: /L-Neuron/L-Neuron/database/index.html#Scorcioni 参考4,神经元数据来源: /CDROM/nmorph/index/topindex_tn.html 本题只考虑神经元形态特征,例如神经元的胞体表面积, 干的数目, 分叉数目, 分支数目,宽度, 高度, 深度,直径,长度,表面积,体积、树干锥度、分支幂律、分支角度或者其他形态参数,几何刻画神经元空间形态特征. 附录文件格式的描述,三维神经元的数据是标准的 A.SWC 格式。一个神经元根据形态空间结构可以离散为很多房室,这些房室用A.SWC 格式文件描述。A. SWC 的格式中,每行包含有神经元一个房室的7个标准数据点: (1)一个房室的标号 (2)房室的类型 (例如 0- 待定, 1- 胞体, 2- 轴突, 3- 树突, 4- 尖端树突等) (3)房室的 x 坐标 (4)房室的 y 坐标

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