福州地区2012年柯萨奇A6型肠道病毒分子特征分析.PDFVIP

中 国人兽共 患病 学报 1124 ChineseJournalofZoonoses 2013。29 (11) DOI：10．3969／cjzj．issn．1002—2694．2013 11．019 福州地区2012年柯萨奇A6型肠道病毒分子特征分析 陈智伟 ，姚 栩 ，陈霄璐 ，谢乃鸿 ，陈 艳 ，张晓阳 摘 要 ：目的 对 2012年福州地 区分离的其他肠道病毒 CVA6进行分子鉴定 ，并对其 VP1部分序列进化分析。方法 肛拭子标本采用 RD细胞进行病毒分离，通过RT—PCR对分离株的VP1部分序列进行扩增、克隆和测序 ；经过 Blast程序 比对 来确定病毒的基 因型 ；通过 Mega4．0软件对不 同病毒株VP1部分序列的差异进行 比较 。结果 从 1O份其他肠道病毒患者的 肛拭子标本 中分离到 6株 CVA6病毒。测序结果显示，该 6株CVA6病毒核苷酸序列具有高度一致性，但与福州周边 国家或 地 区CVA6的核苷酸一致性为 91．8 ～97．3 。结论 2012年福州市 HFMD的病源除 EV71和CVA16外，还包含 CVA6 病毒。序列分析表明，因此，应加强对手足 口病例 中其他肠道病原体 的检测 ，并掌握其流行 以及病毒遗传进化特征，为 HFMD 的防控提供科学依据 。 关键词 ：手足 口病；柯萨奇病毒 A6型；VP1基 因；序列分析 中图分类号 ：R373 文献标识码 ：B 文章编号 ：1002—2694(2013)11—1124—03 PhylogeneticanalysisonCoxsackievirusA6from Fuzhou，China CHEN Zhi—wei，YAO Xu，CHEN Xiao—lu，XIE Nai—hong，CHEN Yan，ZHANG Xiao—yang (FuzhouCenterforDiseaseControlandPrevention，Fuzhou350004，China) ABSTRACT：TheobjectiveistoexplorethevarianceandphylogeneticfeaturesofCoxsackievirusA6isolatedfrom hand— foot—mouthdisease (HFMD)patientsinFuzhou，China，2Ol2．Theana1swab specimenswereculturedonRD cellsforvira1re— covery．A partialsequenceoftheviralprotein1 (VP1)regionwasperformedbyRT—PCR．Thevirustypewasidentifiedwith BIAST，andphylogeneticanalyseswereconductedbyusingMEGA4．0software．TheresultsoftheVP1sequencingshowed that6virusstrainswereidentifiedasCVA6amongtensamplesandwhichsharedhigheridentity．Butthevarianceandphyloge— neticrelationbetweentheCVA6isolatesfrom Fuzhouandthatfrom otherareaswere91．8 一 97．3 ．Theseresultsindicate that。exceptforEV71andCVA16，CVA6infectionsmaybeemergingasanew andmajorcauseofepidemicHFMD．and HFMD pathogensmustbedetectedandclassifiedtocertaintheepidemiologicalcharacteristicsandgeneticevolutionofCoxsack— ievirusinFuzhou． KEY WORDS：hand—footmouthdisease；CoxsackievirusA6；VP1gene；phylogeneticanalysis 手足 口病 (Hand-FoOt-Mouthdis