Gaussian软件的使用-new.ppt

H2O分子单点计算后的.chk文件 转换成.fch文件后，在Chem3D 中所作分子轨道(HOMO)，电荷 密度和静电势空间分布图 例1：使用HF方法，优化 H2O2分子 %chk=h2o2.chk %rwf=h2o2.rwf #p hf/6-31g opt H2O2 energy calculation 0 1 H O 1 0.9 O 2 1.4 1 105.0 H 3 0.9 2 105.0 1 120.0 %chk=h2o2.chk %rwf=h2o2.rwf #p hf/6-31g opt H2O2 energy calculation 0 1 H 0.000 0.000 0.000 O 0.000 0.900 0.000 O 1.350 1.262 0.000 H 1.464 1.742 -0.752 内坐标表示 笛卡尔直角坐标表示 上述两个作业将对H2O2分子的结构进行完全优化，包括所有的键长键角和二面角。 通过将内坐标定义成变量，可以对分子结构进行部分优化 %chk=h2o2.chk %rwf=h2o2.rwf #p hf/6-31g opt H2O2 energy calculation 0 1 H O 1 r1 O 2 r2 1 a1 H 3 r1 2 a1 1 d1 r1=0.9 r2=1.4 a1=105.0 d1=120.0 通过对两个键长和键角使用同一变量定义可以控制分子的对称性 %chk=h2o2.chk %rwf=h2o2.rwf #p hf/6-31g opt H2O2 energy calculation 0 1 H O 1 r1 O 2 r2 1 a1 H 3 r1 2 a1 1 d1 r1=0.9 a1=105.0 变量部分 d1=120.0 r2=1.4 常量部分 通过设定常量，可以使程序 只对分子结构进行部分优化 例2： C2H4分子 平面形分子 # HF/STO-3G OPT C2H4 opt 0 1 C C 1 r1 H 1 r2 2 a1 H 1 r2 2 a1 3 180.0 H 2 r2 1 a1 3 0.0 H 2 r2 1 a1 4 0.0 r1=1.32 r2=1.09 a1=120.0 通过同一个变量控制C-H键长 把二面角定义为180和0的常量 来控制分子的平面构型 例3： CH3F分子 分子点群C3V # HF/STO-3G OPT CH3F C3v opt 0 1 C F 1 r1 H 1 r2 2 a1 H 1 r2 2 a1 3 -b H 1 r2 2 a1 3 b r1=1.38 r2=1.09 a1=110.6 b=120.0 通过常量b来控制C3V对称性 例4： NH3分子 分子点群C3V # HF/STO-3G OPT NH3 C3v opt 0 1 N H 1 r1 H 1 r1 2 a1 H 1 r1 2 a1 3 b r1=0.99 a1=109.0 b=120.0 运行界面 Gaussian Overlay1 Overlay9,10,11,99 L101 L102 L122 Overlay0 L0 L001 Gaussian 程序的结构 link0: 初始化程序，控制占位 link1: 读入并处理计算执行路径，建立要执行的link列表 link9999: 终止计算 Overlay99 L9999 Gaussian03 程序界面 Preferences: 对Gaussian程序进行初始化设置 自定义外部文字编辑器，用来打开.out文件 link.exe所在的文件夹 临时文件存放文件夹 Gaussian03 图形工具栏 开始作业 暂停当前作业 当前link后暂停 终止当前作业和批处理 恢复当前作业 在当前作业完成后终止批处理 终止当前作业 编辑或建立批处理