分子遗传学7精要.ppt

哺乳动物组蛋白H3、H4的N端的修饰 19 Ac：乙酰化；Me：甲基化；P：磷酸化 2. 染色质修饰和基因组表达 第二种影响基因组表达的染色体修饰类型是核小体重塑，即基因组的一个较短区域中核小体的修饰和重新定位，以便于DNA结合蛋白能够接近它们的结合位点。 当然这并不是对所有基因的转录都是必需的，在少数情况下，某些蛋白质启动基因表达是通过结合到核小体表面实现的，并没有影响核小体的定位。 在某些情况下，核小体重新定位被明确地证明是基因激活的前提。 2.2 核小体重塑影响基因组表达 hsp70基因的激活伴随着DNA酶I高敏位点的形成 在黑腹果蝇中，在热刺激情况下，GAGA蛋白激活hsp70的转录。 说明该区域内的核小体被移除了，有一段裸露的DNA暴露出来。 核小体重塑不像乙酰化等化学修饰，它不涉及组蛋白分子的共价修饰。 核小体重塑由能量依赖的过程引发，以减弱核小体和与其结合的DNA间的联系。此过程主要有3种改变： (1)重塑：严格意义上讲，重塑只涉及核小体结构的改变，比如核小体的体积变大，但并不改变位置。 (2)滑动：或顺式取代，即核小体沿DNA作物理移动。 (3)转移：或反式取代，即核小体转移到第二个DNA分子上或相同分子的非相邻区域。 2.2 核小体重塑影响基因组表达 重塑 滑动 转移 核小体的重塑、滑动及转移 负责核小体重塑的蛋白质与HAT一起形成一个大的复合体共同发挥作用，这提示核小体重塑可能和组蛋白乙酰化相偶联。这是一个诱人的假说，因为它将基因组活化中的两个核心反应联系了起来。 3. DNA修饰和基因组表达 DNA甲基化：在真核生物中，DNA中的胞嘧啶有时可由DNA甲基转移酶加入一个甲基而转变成5-甲基胞嘧啶。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 1 2 3 4 5 6 DNA甲基化在低等真核生物中较少见，但在脊椎动物基因组中，高达10%的胞嘧啶都被甲基化，且仅限于5’-CG-3’序列中的胞嘧啶；在植物中可高达30%，限于5’-CNG-3’序列中的胞嘧啶。 在细菌中，DNA甲基化可以避免被自身限制性内切核酸酶降解，并使这些内切核酸酶作用于入侵的噬菌体DNA。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 3. DNA修饰和基因组表达 目前已知存在两种类型的甲基化活性： (1)维持性甲基化：在基因复制之后，负责向新合成的链上对应于亲本链甲基化位点的位置添加甲基。维持性甲基化可确保两个子代DNA分子保持与亲本分子相同的甲基化模式。 (2)从头甲基化：在新的位置添加甲基，从而可以改变基因组局部区域的甲基化模式。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 维持性甲基化和从头甲基化都会导致基因活性的抑制。 通过克隆将甲基化或非甲基化的基因引入细胞，检查它们的表达水平，会发现甲基化的基因不表达。 当检查染色体DNA的甲基化模式时，也会发现具有活性的基因位于非甲基化区域。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 A. DNA甲基化和基因组活性的抑制 例如，人类有40-50%的基因位于靠近CpG岛的位置，CpG岛的甲基化状态反映了相邻基因的表达模式。 那些在各种组织中都有表达的管家基因靠近未甲基化的CpG岛，而组织特异表达的基因仅在其表达的组织中才是去甲基化的。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 A. DNA甲基化和基因组活性的抑制 DNA甲基化是如何来抑制基因表达的呢？ 下面提供一个模型： DNA甲基化和基因组表达之间联系的模型 组蛋白去乙酰化酶复合体 被包装的染色质 在Sin3和NuRD等组蛋白去乙酰化酶复合体中含有一个甲基化CpG结合蛋白（MeCP）组分，MeCP可以识别被甲基化的CpG岛，并引导组蛋白去乙酰化酶复合体与甲基化了的CpG岛相结合。 基因组印记：二倍体细胞核中同源染色体上的某一对基因中只有一个可以被表达，另一个因甲基化而沉默。成对基因中总是同一个基因被印记并因此失活；对一些印记基因来说来源于母本，对另一些印记基因来说来源于父本。 在人类和小鼠中已有60多个基因显示有印记现象，既包括蛋白质编码基因，也包括功能RNA基因。 印记基因在基因组中散布，但倾向于成簇发布。比如：人第11号染色体1Mb的区段内有8个印记基因。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 B. 甲基化参与基因组印记和X失活 人类第11号染色体上的一对印记基因 父本 母本 Igf2，一种生长因子，参与细胞间信号传导。 90kb 印记基因 基因印记是由印记控制元件控制的。 印记控制元件是在印记基因簇几千碱基内所发现的DNA序列，控制了印记区域的甲基化。 印记的功能：可能在发育中起作用。 3.1 DNA甲基化引发的基因组沉默 B. 甲基化参与基因组印记和X失活 X失活是印记一种特殊形式，它导致雌性哺乳动物细胞的一条X染色体完全失活。 这种现象的发生是因为雌性有两条X染