系统进化树的构建图文.pptVIP

实验三.系统发育分析软件的使用 分子系统发育分析 系统发育分析研究是研究物种进化和系统分类的一种方法，研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列，采用特定的数理统计算法来计算生物间的进化关系。并用系统进化树，即一种类似树枝状得图形来概括生物间的这种亲缘关系。 系统发育树构建的相关软件 ClustalX （序列比对软件） ModeltestMrModeltest(碱基替换模型筛选软件) PHYLIP MEGA PHYML PAUP BEAST Figtree (树形显示软件） TreeView （树形显示软件） 实例讲解_MEGA软件构建系统进化树 MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) 该软件是由Kumar等编写的进行分子进化遗传分析的免费软件包，能对DNA、mRNA、氨基酸序列及遗传距离进行系统发生分析。在建树方法上，提供了目前最常用的UPGMA，ML，NJ及MP法，对所获得树也可进自举值检验及标准误估计可靠性检验。 优点为：简单易用 最新版本下载/地址为：http：/ 将抽样过得序列转换 DNADIST Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-20