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- 2017-03-29 发布于湖北
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Freesurfer之ROI映射步骤总结
前提条件：
1、 完成Ubuntu系统及Freesurfer软件的安装配置，熟悉使用Freeview;
2、 完成数据预处理，包括recon-all subjects –all 及 recon-all subjects –qcache;
3、 知道基于freesurfer的几个matlab 函数用法：load_mgh, save_mgh, read_annotation.
[vol, M, mr_parms, volsz] = load_mgh(fname,slices,frames,headeronly)
save_mgh(vol,fname, M, mr_parms), M is the 4x4 vox2ras transform
[vertices, label, colortable] = read_annotation(filename [, verbosity])
4、 .mgh及.mgz是freesurfer使用的MRI volume格式，类似于NifTI, 需用load_mgh和save_mgh函数打开读取或生成.mgh格式文件，从而在freesurfer上使用。
一、 导入matlab函数
在freesurfer的安装路径下，有一个名为matlab的文件夹，里面有一些.m文件用于处理图像，把这个文件夹及子文件夹添加到Ma
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