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BayesianModelAveragingwithBMS

Bayesian Model Averaging with BMS for BMS Version 0.3.0 Stefan Zeugner May 5, 2011 Abstract This manual is a brief introduction to applied Bayesian Model Averaging with the R package BMS. The manual is structured as a hands-on tutorial for readers with few experience with BMA. Readers from a more technical background are advised to consult the table of contents for formal representations of the concepts used in BMS. For other tutorials and more information, please refer to http://bms.zeugner.eu. Contents 1 A Brief Introduction to Bayesian Model Averaging 2 1.1 Bayesian Model Averaging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.2 Bayesian Linear Models and Zellner’s g prior . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 2 A BMA Example: Attitude Data 3 2.1 Model Sampling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.2 Coe?cient Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.3 Other Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 3 Model Size and Model Priors 6 3.1 Binomial Model Prior . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 3.2 Custom Prior Inclusion Probabilities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 3.3 Beta-Binomial Model Priors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 4 MCMC Samplers and More Variables 10 4.1 MCMC Samplers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 4.2 An Example: Economic Growth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

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