基于端粒G四链体受体构建具有抗肿瘤药效团模型汇编
基于端粒G.四链体受体构建具有抗肿瘤功效的药效团模型
演讲:XXX
目录
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背景介绍
计算方法
结果与讨论
结论
01 / 背景介绍
G-四链体
02 / 计算方法
端粒G-四链体的受体配体复合物来源于文献的报道,为分子间的G-四链体四聚体结构,由4条富含鸟嘌呤的DNA单链构成。
其三维结构(PDBID:2JWQ)下载至Protein Date Bank(PDB)数据库。
软件采用美国Accelrys研发的专业生命科学分子模拟。
软件Discovery Studio 3.5中的Structure Based Pharmacophore模块。
二级标题
03 / 结果与讨论
3.1药效团模型的构建
首先进行受体配体复合物的导入,通过复合物的信息可以看到其共有2个结合口袋。分别用不同颜色标注活性口袋周围的残基。
蓝色表示活性位点l、绿色表示活性位点2,中间灰色球状物体为配体MMQ,灰红色相间的为另2条DNA链。
03 / 结果与讨论
3.1药效团模型的构建
用Receptor-Ligand Interactions—Define and Edit Binding Site完成了受体分子的选取,供下一步使用。然后通过Pharmacophore—Edit and Cluster Pharmacophore Features自动产生药
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