山东大学分子生物学总结-JSh山东大学分子生物学总结-JSh.pdf

说明： 下面内容源自课程中心课件，翻译部分参考了钟老师的课件。对课件中的概念性知识进行了 摘取，有些个人认为有用的概念我进行了颜色标注。最后在大多数章节后面我或者对一章的 内容进行了简要的学科归类或者提供了评述。 一、核酸结构 1、遗传物质具有的性质：稳定、组合多样、变异 DNA 是遗传物质的证据：肺炎链球菌的转化实验、噬菌体侵染核酸标记实验 2、DNA 结构 2.1DNA 由两条聚核苷酸链缠绕而成，有大小沟 ---单体核苷酸：脱氧五碳糖、碱基、磷酸基团以及脱水成键反应 ---表示方法：化学基团表示、形象表示、字母表示 2.2 碱基的异构式及生理丰度 2.3 碱基配对原则：A-T,G-C 2.4Watson-Crick 配对原则 2.5 氢键是 W-C 配对原则的基准 ***2.6 base flipping 2.7DNA 的右手双螺旋结构 2.8 大小沟的结构基础：氢键的差别 2.9 氨基酸残基更容易和大沟中的碱基形成非共价识别：氢键的酸碱性不同 2.10 双螺旋的其他构型：A-,B-,Z-的存在条件以及配对碱基的扭转形式 2.11 左手 DNA 双螺旋：糖苷键的顺反式 2.12DNA 氢键的维持：native,melting:pH,heat,salt,etc,annealing,hybridization:artifitial hybrid DNA molecules 核酸纯度的检验：A260/A280 双链熔链的检验：hyperchromicity;Tm:半数 DNA 熔链了的温度，它取决于 G-C 数目、 核苷酸对数、盐浓度 复性动力学：温度、G-C 数目、盐浓度（镁离子）、DNA 浓度、时间、DNA 长度(A260- x factor)DNA 的重复度---?C\C0-C0*t 复性机制：nucleation,zippering;随机结合、和速率和单链浓度的二次方呈正比关系， 当出现重复序列时会呈现平台区 C0t 值直接反应了基因组的复杂度 2.13DNA 可以成环 3、DNA 拓扑学 cccDNA: covalently closed circular DNA 3.1linking number=twist+writhe writhe: interwound, spiral 3.2Lk0 是生理条件下 relaxed-cccDNA 的连接数，如果一环 10.5 个碱基对，则 Lk 可以直 接计算出来，如果大于 10.5 则称此核酸的构型为 supercoil 3.3supercoiled or superhelical:twist 增加 negative superhelix: unwinding sigma#=(lk-lk0)/lk0 3.4topoisomerases: T1:a single strand cut,1 T2: A double strand cut,2 3.5 解开螺旋的中间物是酪氨酸磷酸酯 3.6 电泳可以分开 Lk 特异的 DNA 4、RNA 结构 4.1 互补结构：inter-,intra-,碱基配对 4.2stem-loop 结构,G:U 配对以及三碱基配对,tetraloop 4.3pseudoknots:fold up into complex tertiary structure 4.4Ribozymes:RNase P and self-splicing introns hammerhead ribozyme 的中间过渡态：2’,3’-cyclic phosphate RNA 生物学功能：genetic material, mRNA, tRNA, regulatory molecule: recognition,enzymes 动力学概念：A260，Co*t1/2,电泳区分螺旋度 结构学概念：Lk,stem-loop,tetraloop,RNA tertiary structure 酶学概念：to