生物信息数据库检索系统-第三军医大学生物信息学中心.ppt

第5步: 输入连接密码, 远程图形界面登录成功 视频演示 第6步：退出图形化登陆，删除连接端口号 删除连接端口的命令：vncserver –kill :端口号 例如： * 3.3 编写计算任务脚本 确定需要使用哪个软件来进行计算分析 阅读该软件的使用手册，了解软件的使用方法 根据你的计算任务，编写一个SGE计算任务脚本文件，该文件对你需要系统进行计算的任务进行描述。 * BIC TMMU Example：使用clustalw-mpi进行多序列比对 * BIC TMMU 问题：对来自多个菌种的traG蛋白质序列进行比对 解决思路：使用并行ClustalW程序ClustalW-mpi，对序列进行多序列比对. 参考分析流程： SSH登录系统 上传序列文件 traG.fasta 到自己的目录 编写SGE脚本文件，提交 分析结果 步骤 1：上传待分析的数据 traG.fasta 通过xftp上传数据到用户工作目录 /disk1/zouly/traG 步骤 2：编写mpiblast的计算脚本文件 #!/bin/bash #$ -cwd #$ -j y #$ -S /bin/bash # export MPI_DIR=/opt/openmpi/ $MPI_DIR/bin/mpirun -np $NSLOTS /disk1/biosoft/clustalW-mpi/clustalw-m