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(中文)哺乳动物基因组转录诱导融合基因的研究进展(论文资料)
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生物化学与生物物理进展 Prog. Biochem. Biophys.
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生物化学与生物物理进展
Progress in Biochemistry and Biophysics
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投稿函
尊敬的编辑同志:
《真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展》是根据我们对哺乳动物基因组中转录诱导融合基因进行大规模生物信息分析和实验验证结果及近几年来国外知名期刊所发表的关于该方面的研究进行总结而成。
转录诱导融合基因是一个比较新的研究领域。传统的观点认为基因在染色体上是独立的转录单元,在转录过程中不会产生融合基因。然而转录诱导融合基因的发现可能会提示我们在基因组中除了“一个基因,一个转录单元”的现象,还存在着“多个基因,一个转录单元”的情况。转录诱导融合基因通过基因间剪接把上游基因和下游基因UTR部分的终止密码子和起始密码子切除,成为成熟的转录本;这种拼接方式可能与单个基因内部的剪接机制有本质性的区别,需要进一步进行深入的研究。
目前关于转录诱导融合基因的研究还处于比较原始的阶段,主要单个融合基因进行现象描述,而对于其组织和发育阶段特异性分布、产生机理等还不清楚。我们通过生物信息和实验相结合的方法,在哺乳动物中鉴定出了大量的转录诱导融合基因,这对于研究起进化、组织和发育阶段特异性分布及产生机理等提供了非常有利的条件。
为了让国内外的科研工作者了解和关注转录诱导融合基因,我们对以往的文献报道及我们的部分数据进行了整理,撰写了《真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展》一文。
真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展*
吕聪颖1) 赵刚彬1) 吕贯廷2)**
(1)南阳理工学院计算机科学与技术系,南阳 473004 (2)中国科学院北京基因组研究所,北京 101300;
摘要 真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转???本.融合转录本经过基因间剪接而成为有功的成熟转录本. 本文对真核生物转录诱导融合基因的基因间剪接方式、产生机制和意义进行了综述.
关键词 基因,转录,融合基因
学科分类号 Q7
* 国家自然科学基金重点项目和教育部重点项目(02090)资助项目(注明资助项目类别、名称和批准号)
**通讯联系人:吕聪颖
Tel:0377 E-mail:Alin0378@
收稿日期:2007-4-9
Progress of the transcription-induced fusion gene in eukaryotic genomes*
Lv CY1), Zhao GB1,Lv GT12)
(1) College of Computer Science and Technology, Nanyang Institute of Technology, 473004;
(2)(Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Science, Beijing, 101300
Abstract Eukaryotic genomes are composed of individual genes and the intergenic regions. The transcription of a gene always begins from the transcription start site and ends at the termination site; the gene is referred as an individual transcription unit. However, some sporadic studies indicate that transcription can sometimes read-through the intergenic region and generates a large fusion transcript which contains the upstream gene, intergenic region and the downstream adjacent gene. The fusion transcript becomes a mature functional transcript after intergenic splicing.
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