肺鳞癌差异性长链非编码RNA表达谱分析及初步验证.pdfVIP

第 45 卷第 3 期 温? 州? 医? 科? 大? 学? 学? 报 Vol.45 No.3 第 452015卷 年 3 月 Journal温 州 of 医 Wenzhou 科 大 Medical学 学 报University Mar.2015第 3 期 ·论? ? 著· 肺鳞癌差异性长链非编码RNA表达谱分析及初步验证 潘钦石1，陈 坚 1，许 刚 1，丁鸿燕1，黄卡特2，王瑜敏1 （温州医科大学附属第一医院，浙江 温州 325015，1.医学检验中心；2.病理科） [摘? 要] 目的：探讨及分析肺鳞癌差异性长链非编码RNA（lncRNA）的表达谱并进行初步验证。方法：采 用Arraystar高通量lncRNAs基因芯片研究20例肺鳞癌混合组织及对应的癌旁组织，获得lncRNAs差异性表达 谱。同时采用实时荧光定量PCR方法对40例肺鳞癌相关的lncRNA分子进行验证。结果：本实验所用的基因 芯片包含30?586个lncRNAs和26?109个mRNAs探针；与癌旁组织比较肺鳞癌混合组织出现了1?741条lncRNAs? （≥2或≤0.5倍差异）和1?716条mRNAs（≥2或≤0.5倍差异）差异性表达；信号通路分析显示了P53信号通 路、细胞周期等发生明显变化。我们初步证实了10个lncRNAs分子在肺鳞癌组织中的表达与基因芯片一致， 其中KRT16P2、BC016831是表达差异最为明显的lncRNAs分子。结论：肺鳞癌存在明显的lncRNAs差异性表达， 这些lncRNAs及某些信号通路可能在肺鳞癌发生和发展中发挥重要作用。 [关键词] 肺肿瘤；癌，非小细胞肺；长链非编码RNA；基因芯片 [中图分类号] R446.8 [文献标志码] A DOI: 10.3969/j.issn.2095-9400.2015.03.001 LncRNAs expression profiles of lung squamous cell carcinoma revealed by microarray and valida- tion? PAN Qinshi, CHEN Jian, XU Gang, DING Hongyan, HUANG Kate, WANG Yumin.? 1.Center for Clinical Laboratory, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, 325015; 2.Department of Pa- thology, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, 325015 Abstract: Objective: To analyze lncRNA expression profiles in lung squamous cell carcinoma and pre- limiary validate. Methods: LncRNAs and mRNAs expression profiles in lung squamous cell carcinoma samples compared with NT samples were studied by high-throughput microarray. The interesting candidate lncRNAs were verified by real-time quantitative PCR. Results: Using abundant and varied probes, 30?586 lncRNAs and 26?109 coding transcripts were able to assess in our microarray. From the data we found there were thousands of lncRN