ssr分子标记在作物遗传育种中的应用罗冉.docx

基因组学与应用生物学，2010 年，第 29 卷，第 1 期，第 137-143 页 Genomics and Applied Biology, 2010, Vol.29, No.1, 137-143 评述与展望 Review and Progress SSR 分子标记在作物遗传育种中的应用 罗冉 吴委林 张旸 李玉花 * 黑龙江哈尔滨东北林业大学生命科学学院, 哈尔滨, 150040 * 通讯作者,  HYPERLINK mailto:lyhshen@126.com lyhshen@126.com 摘 要 SSR (simple sequence repeat)是建立在 PCR 技术上的一种广泛应用的分子标记，具有含量丰富、多 态性高、共显性等优点。本文简要介绍了 SSR 分子标记技术的原理和特点，重点介绍了 SSR 分子标记技术 在作物遗传育种中的应用，主要在作物遗传多样性、基因定位、分子辅助标记、遗传图谱构建、品种鉴定和纯 度鉴定等方面进行阐述。 关键词 SSR, 分子标记, 作物, 遗传育种 SSR Marker and its Application to Crop Genetics and Breeding Luo Ran Wu Weilin Zhang Yang Li Yuhua * Heilongjiang Harbin College of Life Sciences of Northeast Forestry University, Harbin, 150040 * Corresponding author,  HYPERLINK mailto:lyhshen@126.com lyhshen@126.com DOI:/10.3969/gab.029.000137 Abstract SSR (simple sequence repeat) is a classic technique for molecular marker based on PCR technique, which had many advantages, such as abundance, high polymorphism, co-dominance etc. This paper has clarified the concept and characteristics of SSR marker, then presents emphatically its application to plant genetics and breeding, and focus on genetic diversity, gene mapping, marker assistant selection, construction of genetic map, varietal identification, purity identification and so on. Keywords SSR (simple sequence repeat), Molecular markers, Crop, Genetics and breeding 遗传标记(genetic marker)是指在遗传分析上用 作标记的基因，也称为标记基因。它可追踪染色体、 染色体的某一节段或某一个基因座在家系中传递的 任何一种遗传特性。目前，应用较为广泛的遗传标 记主要有形态标记(morphological maker)、细胞标记 (cytological maker)、生化 标记(biochemical maker) 和 分子标记(molecular maker)。前 3 类遗传标记都是对 基因的间接表达，并且标记位点少，多态性差，容易受 到环境因素、季节变化等影响，因此发展比较缓慢。 分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记 之后发展起来的一种较为理想的遗传标记形式，它 以蛋白质、核酸分子的突变为基础，检测生物遗传结 构及其变异。分子标记技术从本质上讲都是以检测 生物个体在基因或基因型上所产生的变异来反映生 物个体之间的差异。广义的分子标记是指可遗传的 并可检测的 DNA 序列或蛋白质，狭义的分子标记 指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的 特异性 DNA 片段。目前广泛应用的 DNA 分子标记 有三代，分别为第一代的限制性片段长度多态性 (RFLP)，随机扩增多态性 DNA (RAPD)，第二代的扩 增酶切片段长度多态性(AFLP)，简单序列重复长度 多态性(SSR)，第三代的单核苷酸多态性(SNP)等。本 文主要对 SSR 分子标记技术的原理、特点以及在作 物遗传育种中的应用进行概述。 1 SSR 分子标