- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
生物信息学在高通量测序数据分析中的应用选编
生物信息学在高通量测序数据分析中的应用;提 纲;高通量测序简介;主要测序技术 ;测序的基本反应原理:DNA聚合反应;第一代测序技术 Sanger 法;结合荧光标记和毛细管电泳;测序峰图;ABI 3730 sequencer;Sanger vs NGS;高通量测序技术Roche/454 pyrosequencing;高通量测序技术Roche/454 pyrosequencing;454测序的原理:焦磷酸测序;高通量测序技术Roche/454 pyrosequencing;高通量测序技术Illumina/Solexa;高通量测序技术Illumina/Solexa;Solexa测序的原理:可逆阻断;高通量测序技术Illumina/Solexa;高通量测序技术AB/SOLiD;SOLiD 测序探针介绍;SOLiD Sequencing ;高通量测序技术Life/APG’s SOLiD;高通量测序技术Life/APG’s Ion torrent PGM;高通量测序技术Life/APG’s Ion torrent PGM;高通量测序技术Pacific Bioscience’s single molecule sequencing;高通量测序技术Pacific Science’s single molecule sequencing;Comparison of 5 NGS techniques;高通量测序技术 的主要应用;生物信息学在高通量测序数据中的主要应用;常用生物信息学分析平台与资源;常用基因组拼接软件;基因组比对软件;SNP 分析软件;生物信息学在基因组分析方面的应用基因组de novo测序;WGS (whole genome shortgun);De novo assembly;基因组注释;全基因组成功测序案例;全基因组测序不成功案例;重测序 (Resequencing);
SNP检测,注释和统计
Indel 检测,注释和统计
SV检测,注释和统计
CNV 检测,注释和统计
;SNP calling;A T C G A T C G A A T T C G T A C G A T G C T T A G C T A G C A T A C G;寻找SV
(structure variation);Copy number variation (CNV)
需要一定的测序覆盖度 (10x),mapping depth也需要仔细检查;;;转录组测序简介;转录组研究内容;转录组测序流程;转录组主要分析内容;基因融合分析;Genomic intergenic region;鉴定可变剪接( Alternative Splicing );分析RNA水平SNP;;Small RNA:是长度在18-40nt的非编码RNA,在基因表达调控中发挥着重要的作用。;总RNA;Small RNA分析;Small RNA研究技术比较;;降解组:含有5’单磷酸的mRNA降解片段的集合。;高通量测序在RNA研究中的应用;ChIP-Seq;ChIP-Seq测序流程;ChIP-Seq分析内容;ChIP-Seq分析结果示例
您可能关注的文档
- PLC应用系统设计及实例综述.ppt
- 生活实用小点子选编.doc
- PLC控制恒压供水系统综述.doc
- PLC梯形图程序设计方法及应用实例综述.ppt
- PLC控制技术模拟卷综述.doc
- 生活圈(发现美好生活在身边)介绍PPT选编.pptx
- PLC的产生、基本特点和主要功能综述.ppt
- PhotoShop的使用综述.doc
- PLC自动洗衣机控制毕业论文综述.doc
- 生活方式与健康长寿x选编.ppt
- 贵州贵州省建设投资集团有限公司招聘考试真题附答案详解(研优卷).docx
- 河南南阳师范学院2021年招聘25名硕士研究生冲刺卷一(附答案与详解)及答案详解(名校卷).docx
- 陕西延长石油 (集团) 有限责任公司 所属单位招聘笔试题库及答案详解(必刷).docx
- 贵州民航产业集团有限公司招聘笔试题库含答案详解(基础题).docx
- 广汉市2025年公开招聘社区专职工作者(125人)考试备考题库含答案详解(考试直接用).docx
- 邢台市水务发展集团有限公司招聘真题附答案详解(实用).docx
- 新华保险总部人力资源部(党委组织部)招聘笔试题库含答案详解(预热题).docx
- 贵州苔茶产业发展集团有限公司招聘笔试题库含答案详解(b卷).docx
- 广汉市2025年公开招聘社区专职工作者(125人)考试备考题库附答案详解(综合题).docx
- 贵州城乡产业发展集团有限公司招聘笔试题库附答案详解(实用).docx
文档评论(0)