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主成分分析理论介绍和举例
吴 海 龙
湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室
E-mail: hlwu@hnu.net.cn;;Chemometrics ?;一次测量得到一个值
例如: 温度、压力、pH、
单波长的吸光度
等;分析仪器的高性能化
例如: UV-可见分光吸收光谱
IR、 NIR、荧光光谱
GC、LC、MS
NMR、等
样品-浓度数据
样品-变量-时间
等等; 分析过程; 分析化学中常用方法;1Principal Component Analysis(PCA);主成分分析 (PCA);PCA 例子;Tmc vs Bmc;X矩阵中含有8个样品和两个变量
方差协方差阵为: 77.71 76.29
76.29 80.86
也即,它使用平均化的X矩阵XTX(列数-1)
特征矢量
# 特征值 B的系数 T的系数 方差百分数
1 155.59 0.6998 0.7144 98.1
2.98 0.7144 -0.6998 1.9
方差= /(样品数-1);PCA方差协方差矩阵;
夹角余弦
cos(?ij)= (? xik? xjk)/(? ? xik2?? ? xjk2)
相关系数
cos(?ij)=[?(xik-mi)?(xjk-mj)]/(? ?(xik-mi)2?? ? (xjk-mj)2)
其中mi和mj分别表示第i和第j个样本的均值.;PCA;PCA;Lamda:
1 2
155.5876 2.9838
Eigenvector:
0.6998 0.7144
0.7144 -0.6998;特征矢量1和2;特征值与特征矢量;PCA 的术语;PC1和PC2的表示;PCA的优点;;用PC1对X阵近似; 用PC1对X阵近似 ;X 残差;PC1对X阵的贡献;PC2对X阵的贡献;得分的平方和;常用的 PCA;PCA;PCA;以上为8x2的矩阵,可变为2x2的矩阵;Single value decomposition;主成分分析投影的数学意义;主成分分析数学几何意义;投影;主成分分析的数学与几何意义示意图 ;2Principal Component Regression(PCR);Lambert-Beer Law;PCR 方法是采用多元统计中的成分分析方法,先对混合物量测矩阵 Y 矩阵直接进行分解,然后只取其中的主成分来进行回归分析,故有主成分回归之称。;方法模型;PCR Advantages;PCR Disadvantages;3 Partial Least SquaresRegression (PLSR);PLSR 方法不仅直接对混合物量测矩阵 Y 进行正交分解,而且同时对浓度矩阵 C 进行正交分解。;方法模型;NIPLS算法步骤;
9. 进行回归运算:b1=rt1/(tt1t1)
10. EY,1=Y-t1vt1 ; EC,1=C-r1qt1=C-b1t1qt1
11. EY,1用代替Y, EC,1代替C,返回主因子迭代过程9-10,算下一个主因子:r2, qt2, t2, vt2
得到EY,2 ,EC,2,直到得到所有的Y和C的主因子(可用交互校验法和方差比较来决定)
12. 由储存的Vt* Y未知(Y=T*Vt*) t未知
r未知 ( b=rt/(ttt) )
由储存的Qt* C未知(C=R*Qt*);The geometric representation of PLSR. The X-matrix can be represented as N points in the K dimensional space where each column of X (x_k) defines one coordina
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