CYP725A4分子序列分析与结构建模.pdfVIP

华 南 理 工 大 学 学 报 ?自 然 科 学 版 ?? 第 ??卷 第 ?期? ???????????????????????????????????????????????? ???，??? ??．?? ????年 ?月? ?????????????????????????? ? ??? ????? 文章编号 ：????—????????????—????—??? ????????分子序列分析与结构建模 术? 蒙海林?，? 汪建峰?，? 王勇? 张嗣 良。? 王小宁? ??．华南理工大学 生物科学与工程学 院，广东 广州 ???????；?．中国科 学院上海 生命科学研究 院? 合成生物学重点实验室 ，上 海 ??????；?．华东理工大学 生物反应器工程 国家 重点 实验 室 ，上海 ???????? 摘 要：????????在大肠杆菌等原核宿主 中难以实现 高效功 能表达，是制约紫杉醇异? 源合 成 的瓶 颈之 一 ．文 中利 用生物 信 息学方 法对 该酶分 子 的序 列进 行 疏水 性 和跨 膜 区分? 析 ，构建 了其分子进化树 ，在此基础上用 同源建模方法构建 了其天然态以及切 除 ?端跨? 膜区后 的三级结构 ，并对 ????????实现功能表达所必需的辅助还原酶也进行 了天然 态? 和切 除 ?端跨膜 区后 的三级 结 构建模 ．所 构 建的 结构 模 型 经 ????????验 证 具有 较 好? 的 可靠性 ．? 关键词 ：生物信息学；细胞 色素 ????酶 ；序列分析 ；分子建模；功能表达? 中图分类号 ：?????．?? ???：??．????／?．????．????．????．?????．??．???? 植物来源的细胞色素 ????酶在大肠杆菌等原? ????，????：∥???．????．???／???／????／????．???中? 核宿主中很难实现功能表达，从而给异源合成紫杉? 膜蛋白所 占比例极小 ，而属于 ????超家族的结构数? 醇等高附加值 天然产物 带来 困难? ?．紫杉醇生物? 据更为缺乏 ，因而 目前尚不能基于 目标 ????蛋白的? 合成 途径 中涉 及 到多步 ????酶催 化 的羟 基化 反应 ，? 真实结 构进行 理性 的分 子设计 从 而更好 地实 现其 功? 其 中 ???????????由 ?????????催化 的第 ?步羟基? 能 ；但是 ，在少 数 已知 蛋 白结 构 的基 础 上 可 以通 过? 化反应 已经成 为 制约 紫杉 醇异 源 合成 研 究 的瓶? 同源结构建模而得到未知的 ????蛋白结构模型．这? 颈 ????．目前这 步 反 应 在 异 源 宿 主 中 得 到 的基 本 上? 些