八章节 动物基因组学基础.pptVIP

第八章??动物基因组学基础;;;;;图7-1 Southern杂交过程;图7-2 RFLP检测; ;图7-3 DNA扩增原理;;图7-4 PCR—RFLP;;;图7-6 卫星DNA; ○小卫星标记 小卫星DNA是一种可变数量的串联重复（varible number of tandem repeats, VNTR），在不同个体和基因组的不同位点上数目都不同。 用内切酶把总DNA切成不同长度的片段（VNTR上没有酶切位点），再以VNTR中的特殊序列为探针进行Southern杂交，由于不同个体的这种串联重复的数目及位置不同，所以VNTR的Southern杂交谱带具有高度的个体特异性，故又称其为DNA指纹（DNA fingerprints）。;;真核生物基因组序列;一个家系的微卫星PCR检测结果;; SNP是出现频率最高的标记，人类基因组中平均每1000 bp中就有1个SNP，总数可达300万个。 位于基因表达序列内的SNP可能会影响蛋白质的结构和表达水平，对分析基因与性状的关系有重要意义。 SNP是单碱基突变，任何用于单碱基突变的技术都可用于SNP检测，如RFLP、DNA序列分析、单链构象多态性（SSCP）等。最先进的是微数列矩阵DNA芯片（DNA chip）技术。 ?;;;; 经典遗传图的作图最常用的是三点测交法。 现代遗传图的概念是于1980年提出的，就是将单纯的表型多态性界标改变为以DNA序列的多态作为作图界标。 各种遗传界标可在国际互联网上可以查阅（）。 当用DNA序列多态作为界标的遗传图时，一但确定该DNA界标与某一基因的具体位置，便可分离克隆这个基因。 人类第一张以RFLP为界标的遗传图发表于1987年。;;;;图7-16 限制性内切酶;; ○ STS 的种类 ⑴ 表达序列标记（expressed sequence tag, EST），是从cDNA克隆中获得的短序列。EST是获得基因序列的简捷方法。 ⑵ 简单序列长度多态性（SSLP，小卫星和微卫星）。 ⑶ 随机基因组序列，从克隆的基因组DNA中随机测序获得。;; 一、质量性状的基因定位 质量性状——从表型上可以明显区分为不同类型的性状。 （一）家系分析定位法 性连锁分析是最常用的方法。哺乳动物中只出现在雄性的性状，控制该性状的基因在Y染色体上。性状出现隔代交叉遗传、且雄性出现比例高于雌性，则控制该性状的基因在Y染色体上。 （二）遗传重组值定位法 摩尔根提出的方法，根据基因间的重组值与遗传距离成正比的原理，采用两点测交和三点测交的方法进行基因定位。;; （四）原位杂交定位 将待定位基因的特定DNA序列或该基因转录的RNA作为探针，在标记了放射性同位素或非放射性化学物质后，与变性后的染色体DNA杂交，该探针就会同染色体DNA与其互补的序列结合成为双链，通过放射自显影或显色技术，就可确定探针（即待定基因）在染色体上的位置。; 二、数量性状的基因定位 ○ 数量性状——由微效多基因控制的呈连续变异的性状。由于每个基因效应值都较小，无法阐明单个基因的行为和效应，只能当作一个整体来分析。同时，对控制数量性状的基因数目不能准确估计，不能用提供基因的实际位置和功能上的信息。 随着分子数量遗传学的发展，极大地深化了数量遗传学的理伦，提供了在DNA水平研究数量性状的先进技术。;;;; 定位QTL主要有两种方法： 基因组扫描——利用遗传上差异较大的品种进行杂交，跟踪性状和染色体上的标记在多世代家系中的分离情况。 候选基因法——不需特定品种的杂交，只要发现一个候选基因位点上存在多态性，便可直接在商业品系中研究该多态性与目标性状之间的相关性。; ;;; 二、人类基因组计划 ○ 美国于1990年由能源部和国立卫生研究院起动了预算耗时15年、经费30亿美元的人类基因组计划 ○ 2001年2月15日，由中、美、英、法、德、日等6国科学家组成的“人类基因组测序国际协作组”，在《自然》杂志上发表了关于人类基因组框架图的数据；次日，美国Celera Genomics公司的也公布了人类基因组框架图的数据。有关人类遗传本性的“生命之书”的诞生，是生命科学发展史上的一个重要里程碑。; ;;