基于矩阵得分的蛋白质β-hairpins模体识别.pdfVIP

????年 第 ?期? 牡 丹 江师 范 学院 学 报 ?自然科 学版 ?? ? ?，?，????? ?总 第 ??期 ?? ???????????????????????????????????????? ??????????? 基于矩阵得分的蛋白质 ??????????模体识别? 姜? 雪 ，马? 芳? ?沈 阳 工业 大学 辽 阳校 区基 础 部 ，辽 宁 辽 阳 ???????? 摘 要 ：用矩阵得分的方法 ，从蛋 白质 的氨基 酸序 列 出发 ，以氨基 酸 紧邻 关联为 参量 ，分 别对 ?????个和? ???????口一????????模 体 进 行 识 别 ．利 用 ??一??????????—??????????检 验 ，识 别 总 精 度 分 别 达 到 ??．?? 和 ??．?? ．? 关 键 词 ：?????????模 体 ；位 置得 分矩 阵 ；序 列模 式? ?中 图分 类 号????? ?文 献 标 志 码 ??? ?文章 编号 ?????—????????????—????—??? 蛋 白质 超 二级结 构 常常参 与一个 大 的结构 或? 下三 个标 准 ：???序 列 所 属 蛋 白质 的 分 辨 率 低 于? 功能 组 件 ，行 使 生 物 学功 能 ，因此 ，超二 级 结 构 预? ?? ??；???序 列 中不 含 有 非 规则 氨基 酸 ；???在 各 二? 测具 有很大 的现 实 意 义．利 用 理论 计 算 的方 法预? 级 结构 单元 中 至少 包 含 两个 连 续 的 氨基 酸 残 基．? 测蛋 白质超 二级 结 构 是一 个 新 兴 的 研究 领 域 ，其? 基 于 以上标 准 ，获 得 了 ?????个 相 似性 小于 ??? 预测方 式主要 有 两 类 ，一 是 对全 部 超 二 级结 构 类? 的蛋 白质 中的 ?????个? ????????，?????个 ???—? 型的 预测 ，二 是对 特殊 结 构模 体 的 预测 ．????年 ，? ????????；二 是 ?????【??数 据 集 ??????：／／?????．? ??????】利用统 计 的方法 对 ???个 蛋 白质 进行 了研? ????．????????．???／???／???／?????．，?????? ?—? 究 ，给 出了常 见 的 ??种 蛋 白质超 二 级 结构 形 式 ；? ?????? ??