第2章微生物分子生态学.ppt

第2章：微生物分子生态学;2.1：微生物分子生态学概念; 微生物分子生态学是分子生物学实验技术应用于微生物生态学研究领域而发展形成的一门交叉学科，在分子水平上探讨微生物生态系统组成结构、功能的机理以及微生物与生物和非生物环境之间相互关系。其核心问题是研究微生物生存的环境分子生态效应和遗传分子生态效应。;微生物分子生态学研究范围 微生物进化 不可培养微生物 群落结构与多样性 极端环境微生物 基因转移 微生物与人类健康 抗生素抗药性 微生物资源 信号传递 等。 致病与免疫 ;2.2：微生物分子生态学理论基础;环境造就生物，生物改造和修饰环境 ; （2）微生物与细胞间的信息交流 细胞信号传递一直是生物学研究的热点，分子生物学的发展揭示了许多动物细胞信号交流和传导途径。 长期认为微生物只能感受环境变化，微生物间没有交流，但群体感应的发现表明微生物细胞之间存在信息交流。; 微生物与细胞间的信息交流，探讨的是微生物在生物细胞内环境的分子生态效应，可以进一步揭示细菌、病毒对人和动植物感染的调控作用，以及微生物次级代谢产物对其它生物的拮抗、抑制和杀灭的分子机制，探索寄生、共生、腐生等原理，为生物防治和健康医学注入新的活力。; （3）分子生态病毒学 分子生态病毒学是由分子生物学、分子生态学和分子病毒学融合而成的新兴分子学科。;HIV：人类免疫缺陷病毒（Human Immunodeficiency Virus），是一种RNA病毒，该病毒破坏人体的免疫力，导致免疫系统失去抵抗力，从而使得各种疾病及癌症在人体内生存，并致人死亡。;SARS：严重急性呼吸综合征（Severe Acute Respiratory Syndrome），也叫传染性非典型性肺炎，SARS是一种冠状RNA病毒。;MERS： 中东呼吸综合征（ Middle East Respiratory Syndrome ），MERS-CoV，一种新型冠状病毒。截止2015年5月25日，全球累计实验室确诊病例共1139例，其中431例死亡（病死率37.8%）。; （4）微生物在环境修复中的分子生态学 微生物修复（bioremediation）指通过微生物的作用清除土壤和水体中的污染物，或是使污染物无害化的过程。它包括自然和人为控制条件下的污染物降级或无害化的过程。 微生物群落结构及其动态变化 微生物分子多态性 微生物遗传进化;2.3：微生物对外界环境的适应和调整; （1）营养因子对微生物的影响;碳源 用于构成微生物细胞和代谢产物中碳素的来源，并为微生物的生长繁殖和代谢活动提供能源。 主要功能 提供微生物生长繁殖所需的能源； 提供微生物合成菌体的碳成分； 提供合成目的产物的碳成分。 ;氮源 氮源是指构成微生物细胞物质和代谢产物的氮素的来源。 主要功能是： 构成微生物细胞结构物质，如氨基酸、蛋白质、核酸等； 合成含氮代谢产物； 作为酶的组成分或维持酶的活性； 调节渗透压、PH值、氧化还原电位等； 当培养基中碳源不足时，可作为补充碳源。 ;无机盐和微量元素 微生物在生长繁殖和代谢产物的合成过程中，还需要某些无机离子如硫、磷、镁、钙、钠、钾、 铁、铜、锌、锰、钼和钴等。 各种不同的产生菌以及同一种产生菌在不同的生长阶段对这些物质的需求浓度是不相同的。 无机盐及微量元素对微生物生理活性的作用与其浓度相关，一般它们在低浓度时对微生物生长和目的产物的合成有促进作用，在高浓度时常表现出明显的抑制作用。 ; 营养因子对微生物的影响符合Liebig定律。; 遵循这一原理，我们可以有目的的促进有益微生物、抑制有害微生物的生长。; 遵循这一原理，我们可以有针对性的对环境样品进行富集，得到所需的功能细菌。 硝化细菌 硫细菌 污染物降解菌; 遵循这一原理，在污水处理过程中，碳氮比要维持在一定水平，如果保证碳氮比合适，可促进正常微生物菌群的生长，抑制球衣细菌等丝状菌的生长引起的污泥膨胀等问题。; （2）光影响微生物的分子生态学; 已知的光合色素有三类：叶绿素或细菌叶绿素、类胡萝卜素和藻胆素。光合细菌因所含的细菌叶绿素和类胡萝卜素的量和比例不同，其菌体呈现红、橙、绿、蓝绿、紫红、紫或褐等颜色。;; 蓝细菌(Cyanobacteria) ：蓝细菌曾被称为