GoPubMed用于医学科技查新分析 - 科学网—博客.docVIP

PAGE  PAGE 6 GoPubMed用于医学科技查新的信息分析 中国医学科学院医学信息研究所 许培扬 张玢 摘要 采用GoPubMed在线信息分析软件将医学科技查新课题的相关文献进行统计分析，包括文献的研究主题、著者、期刊、年代、城市和国家的分布。医学科技查新中对相关文献进行定性与定量相结合的分析方法，以保证科技查新的更为全面、客观、准确。 关键词 GoPubMed；医学科技查新；医学信息分析 GoPubMed的统计分析功能 GoPubMed(/)是一种Pubmed检索工具，其数据源与美国国立医学图书馆的PubMed完全一样，其本身并没有数据库，其原理为将读者检索提问词提交给PubMed，接收PubMed的检索结果，利用GO（gene ontology,GO-基因本体）和MESH（医学主题词表）对检索结果进行提炼，利用算法从中提取GO术语和MESH主题词，自动生成临时基因本体和医学主题词表，从而对检索结果进行分类，读者可以根据这些分类快速找到自己需要的文献，而不需要将检索到所有文献进行阅读。 GoPubMed统计分析功能具有对所有检索结果或单独对分类类目中的术语在PubMed中检索得到的文献进行的统计分析，包括对检索到文献从年代分布、核心著者、核心期刊、著者分布可视化地图。 1．研究主题：统计发表文献最多的前20个名主题词或关键词，可以看出主要研究领域、学科主题。2. 核心著者：统计发表文献最多的前20名作者，同时可以直接查看每名作者发表的文献，可以了解本领域的权威研究者，可以重点关注其研究方向，了解该领域的研究重点。3. 核心期刊：统计发表与检索词语相关文献最多的前20种期刊，可以直接查看每种杂志发表的相关文献，通过这些核心期刊检索者可以了解平时需要重点关注哪些期刊。 4. 年代分布：统计GO和MeSH类目术语对应近20年发表文献的年度分布，并用图表的形式进行显示。5. 著者的城市和国家分布：统计发表与检索词语相关文献最多的前20名城市和国家，可以直接查看这些城市和国家发表的相关文献。 6. 国家或地区分布可视地图。可视化地在世界地图上用红点标示发表相关文献的国家和城市,检索者据此可以了解该领域的研究态势，究竟有哪些国家或哪些城市在进行相关的研究。 GoPubMed 与SCI信息分析功能比较： 《科学引文索引》(Science Citation Index, SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，是世界范围最权威的科学技术文献的索引工具，属于收费数据库。2007年收录自然学科期刊6300种，其涵盖的学科超过100个，主要涉及农业、生物及环境科学、工程技术及应用科学、医学与生命科学、物理学及化学等。SCI主要功能是对文献进行评价，包括影响因子(IF值)、被引用次数、及时因子、h指数，另外也提供对检索结果的统计功能，包括：作者、国家、机构、出版年份、来源刊物等。PubMed收录生命科学与医学领域期刊有5000余种，GoPubMed是一个免费的对PubMed检索结果进行数据挖掘的工具，目前只能对1000条数据进行显示和统计分析，其统计指标为年份、期刊、国家、城市、合著者等，没有对引用情况和被引用情况进行分析，由于被处理的文献记录条数最多1000条，所以其统计分析结果只能作为一个参考，而SCI虽然其生命科学期刊数量比PubMed少，由于其分析较为全面，但是目前还没有一个比其更适合的统计分析工具。GoPubMed是一个对PubMed进行智能检索、分类导航的理想工具，也是一种对检索结果进行多角度统计分析的软件，通过它检索者可以很快了解检索到的文献的概貌和本研究领域的研究态势。 三、医学科技查新实例 查新课题：茶多酚抗肿瘤新生血管生成机制研究（Research on tea polyphenol inhibiting cellular molecular mechanism Of cancer angiopoiesis） 1．研究内容 依据既往研究基础，进一步完善茶多酚对大鼠主动脉无血清培养形成微血管结构的影响。重点研究内容在于建立小鼠肉瘤(S180)与乳腺癌(MCF-7)两种动物模型，以肿瘤抑制率、肿瘤微血管密度、金属蛋白酶组织抑制因子Ⅱ、血管生成因子表达为主要观察指标，比较茶多酚灌胃、腹腔与局部注射三种途径抗肿瘤新生血管生成效应。 2．研究目标 预期达到的目标为：①确定茶多酚是否具有抑制实验性肿瘤血管生成效应，评估临床应用的可能性与前景。②从抑制肿瘤血管生成角度，探索与发现茶多酚抗肿瘤作用新机制。③为使用肿瘤血管生成抑制剂提供合理给药途径。 3．关键问题 ①以现有肯定效果的抗肿瘤血管生成中药为对照药，通过检测相关指标，比较作用靶点，评估异同性，试图发现抗肿瘤血管