南京大学 分子生物学 课件 第23讲.ppt

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南京大学 分子生物学 课件 第23讲

3,酵母接合型相关匣子 (1)序列组成(表9-1) (2)沉寂匣子的阻遏蛋白及其结合位点 (3)沉寂匣子不活跃转录的原因;(二)哺乳动物免疫球蛋白的表达与基因重排 1,轻链 (1)种类 (2)结构 (3)基因及基因重排;A,轻链的V,C,J(如Vκ,Cκ,Jκ)基因在不产生抗体的细胞中相距很远,在产生抗体的细胞中被排列组合重排在一起,V和C之间是较短的J片段。轻链V区是由V基因片段和J基因片段共同编码的;B, ?链的形成 C, ?链的形成 2,重链 (1)种类 (2)结构 (3)基因及基因重排;3,免疫球蛋白类型的转换 (1)抗体类型的转换现象 (2)抗体类型的转换的机制;二、染色体水平上的基因活化调节 (一)染色质的状态 1,非活性染色质的结构 2,活性染色质的结构;(二)开放染色质结构的形成 1,DNA结构的影响 2,组蛋白的修饰 (1)H1组蛋白的磷酸化;(2)核心组蛋白的修饰 A,核心组蛋白的乙酰基化 B,H2A组蛋白的泛素化 (3)其他DNA结合蛋白的作用 A,启动子上游调控因子 B,HMG结构域蛋白;(三)活性染色质的特征 1,DNA酶I敏感位点 (1)活跃基因的DNA酶I优先敏感性 (2)活跃基因DNA酶I优先敏感性区域的分布 (3)造成DNA酶I优先敏感性的原因 (4)DNA酶I优先敏感性与基因转录的时间关系 ;2, DNA酶I超敏感位点 (1)DNA酶I超敏感点及其定位方法 (2)超敏感点与基因活性的关系 (3)超敏感点与基因转录的时间关系;(4)超敏感点的特点 不是特定的碱基位置,而是一段100~200bp的DNA序列 至少一部分序列以游离DNA形式存在 可能有局部的解链 与其下游转录起始位点距离因基因而异; ;(四)DNA的甲基化和去甲基化 1,真核生物基因组DNA甲基化 (1)真核生物DNA甲基化位点 真核生物DNA的mCpG是DNA甲基化的唯一形式 一般哺乳动物基因组5%的胞嘧啶甲基为mCpG,且在DNA双链对称出现, mCpG占全部CpG的70%;(2)基因的甲基化状态 高度甲基化(如:女性的一条X染色体) 诱导的去甲基化(如:组织或发育阶段特异性表达基因) 持续低水平甲基化(如:持家基因);;(4)用于甲基化研究的限制性内切酶(图9-8) HpaⅡ:识别并切割未甲基化的CCGG MspⅠ:识别并切割所有的CCGG;2,甲基化DNA的结合蛋白 (1)MeCP1:在体外结合至少12对mCpG,是参与甲基化对基因转录抑制的主要蛋白 (2)MeCP2:结合一个mCpG碱基对,生物学意义不详;3,DNA甲基化的转录抑制 (1)哺乳动物以CpG甲基化程度为标准的启动子分类;A,CpG岛启动子 在某些持家基因的启动子附近CG高度集中(较其他区域高10~20倍),形成长达0.5~3kb的富含CG区域,称为CpG岛。 CpG一般不能和MeCP1结合;B,组织特异性启动子 CpG相对较少,在大部分组织中为甲基化状态,受DNA甲基转移酶调节;(2) DNA甲基化与基因表达活性的负相关性 A,限制酶研究结果:活跃基因表现为甲基化不足 B,用5-氮胞苷人为造成去甲基化可诱导基因表达;C,在特异性表达某些基因的组织中,活化基因附近mCpG降低至其他组织中的30% D,有H1的压缩状态核小体中含有哺乳动物和DNA中80%的mCpG;4,DNA去甲基化位点的特点 (1)范围和DNA酶I优先敏感区域十分吻合 (2)只有一小部分CG二核苷酸对的去甲基化与基因激活有关,它们位于对基因表达关系十分密切的序列中;5, DNA甲基化位点的维持及去甲基化位点的产生 DNA甲基化酶可以识别半甲基化的CG二核苷酸对并使之完全甲基化 去甲基化可以由去甲基化酶催化产生,或是在DNA复制时甲基化酶未能在半甲基化处催化甲基化;6, DNA甲基化/去甲基化对基因活性调控的相对性 (1) DNA甲基化程度因物种而异 DNA甲基化随进化程度的提高而增强;(2) DNA甲基化/去甲基化对不同基因活性有不同影响 例子:非洲爪蟾rDNA的活性不受DNA甲基化/去甲基化的影响,而其他基因不同 原因:可能与转录所用的RNA聚合酶种类有关;第四节 转录水平的调控;一、Britten-Davidson模型 (一)保证各种细胞类型表达“正确”的基因组合的方法 1,多拷贝基因的组织特异性调控 不同类型的细胞通过与细胞类型特异的方式控制多拷贝基因的表达;2,单拷贝基因的复合控制系统 (二)真核生物基因表达的复合控制系统 1,真核生物基因表达调控的基本要素(图9-9) (1)结构基因 ;(2)接受位点 位于结构基因的5‘端,可被激活因子(蛋白质或RNA)识别 一个结构基因可以有不同的接受位点 含有相同接受位点的基因属于一组(set)基因;(3)综合者基因 编

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