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5、拒绝域的建立: 6、结论 青霉素口服效果与注射效果差异不大。 注意:2×2列联表卡方检验与之前讲的吻合度检验一样,要求理论数不得小于5;当理论数小于5时,应使用2×2列联表精确检验法。 二、r×c列联表 行数和列数都大于2时的情况称为r×c列联表,其理论数的计算仍为 例6 植物转基因方法常用的有三种:基因枪介导转化法、农杆菌介导转化法和花粉管通道法,三种方法转化烟草的成功率(种子数)如表所示,问三种转基因方法的转基因成功率差异是否显著? 转基因方式 阳性种子 假阳性种子 总数 基因枪法 192 3378 3570 农杆菌法 319 3297 3616 花粉管法 194 3620 3814 总数 705 10295 11000 三种方法转化烟草的实验结果 题解 1、提出假设 H0:O-T=0;HA: O-T≠0 2、根据概率的乘法法则计算理论数:理论数 转基因方式 阳性种子 假阳性种子 总数 基因枪法 O1=192 T1=228.8 O2=3378 T2=3341.2 3570 农杆菌法 O3=319 T3=231.8 O4=3297 T4=3384.2 3616 花粉管法 O5=194 T5=244.4 O6=3620 T6=3569.6 3814 总数 705 10295 11000 三种方法转化烟草的实验结果的理论数 3、检验统计量: 4、确定自由度: 列联表的自由度df=(r-1)(c-1),r是列联表的行数,c是列联表的列数, df=(3-1)(2-1)=2,不用做连续性校正 5、拒绝域的建立: 6、结论 三种转基因方法的成功率显著不同。 三、 2×2列联表精确检验法 a b a+b c d c+d a+c b+d N=a+b+c+d 检验程序: 1、求组合概率:p值表示的是在行总数和列总数保持不变的情况下,上述列联表出现的概率 2、提出假设:列联表精确检验的零假设仍为不存在处理效应,显著水平为α 3、检验统计量:即p值,若a、b、c、d中任何一个出现0时,可直接用上述公式计算p值,反之则应当保证行总数和列总数不变的条件下,将4格中最小的那个数再逐个(每次降1)降低到0,得到2个或多个2×2列联表,并计算每种2×2列联表的p值,并将多个p值之和作为总概率p 4、拒绝域的建立 5、结论 两种农药灭杀棉铃虫效果的差异 农药 存活 死亡 总计 氧化乐果 2 3 5 一扫光 0 6 6 总计 2 9 11 人类性别对白酒香味反应的差异 性别 有 无 总计 男 4 1 5 女 3 6 9 总计 7 7 17 1、p=0.181820.05 两种农药的杀虫效果差异不显著 2、(1)因为4个观测值中没有0出现,先计算本表的概率:p1=0.122 (2)因为观测值中最小数是1,在保证行总数和列总数都不变的条件下,将1降到0的情况只有一种,P2=0.010 人类性别对白酒香味反应的差异(降序后) 性别 有 无 总计 男 5 0 5 女 2 7 9 总计 7 7 17 P=p1+p2=0.1320.05 结论:男女对该酒精香味的反应没有区别 * 第七章 拟合优度检验 教学目的要求 掌握:拟优合度检验的基本原理和步骤,不同资料类型分布的拟合度检验,独立性测验方法。 熟悉:拟合优度检验和独立性检验的应用。 了解:拟合优度检验在遗传学及其他生物学科中上的应用。 讲授内容 一、拟合优度检验的一般原理 二、拟合优度检验 三、独立性检验 一、拟合优度检验的一般原理 1、拟合优度检验(goodness of fit)定义: 用来检验观测数与依照某种假设或分布模型计算得到的理论数之间一致性的一种统计假设检验,以便判断该假设或模型是否与实际观测数相吻合。 拟合优度检验 吻合度检验 独立性检验 检验观测数与理论数之间的一致性。 通过检验观测数与理论数之间的一致性来判断事件之间的独立性。 2、拟合优度检验的程序 将观测值分为k组 计算n次观测值中每组的观测频数,记为Oi 根据变量的分布规律或概率运算法则,计算每组的理论频率为Pi 计算每组的理论频数Ti 检验Oi与Ti的差异显著性,判断两者之间的不符合度 a、零假设:H0:O-T=0;备择假设: O-T≠0(这里检验的不是参数,而是判断观测数是否符合理论分布) b、检验统计量:这里要求n充分的大,当n≥50时(最好≥100),所定义的检验统计量近似服从卡方分布,Ti=nPi不得小于5,若小于5,将尾区相邻的组合并,直到合并后的组的Ti≥5,合并后再计算卡方值。 c、建立拒绝域 d、作出统计学结论 (一)总体参数未知的正态性检验 155 153 159 155 150 159 157 159 151 152 159 158 153 153 144 156
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