代谢组学与癌症研究.doc

代谢组学与癌症研究 一、问题提出 在心血管疾病和关节炎疾病在代谢组学领域受到广泛的关注和应用。这门学科应用跨越生物技术和医药技术，具有广阔的发展前景。自从Otto Warburg提出Warburg效应（正常细胞主要通过OXPHOS产生ATP，而癌细胞主要通过糖酵解产生能量）后，运用代谢组学的原理解决预测癌症问题已经成为一个热门的话题。它预示着许多形式的代谢组学研究结肠癌、乳腺癌等癌症研究即将产生。早期预测癌症又是一个非常困难的问题，但是代谢组学能在初期就能做到很好的探测。 二、科学意义 尽管代谢组学已经被提出了二十多年，但是在临床医学研究上远没有其他几门学科（基因组学、转录组学、蛋白质组学）受重视。内环境的改变都会直接表现在代谢物上。它相对于其他几门学科有一些优势。1、机体对内环境的稳态要求比较高，所以些许的变化都能引起反应。代谢组学研究物更易观察，对所需观察事物更为敏感，代谢产物是基因表达的最终产物，基因和蛋白表达的微小变化可以在代谢物上得到放大；2、生物指标来源（样品）更为便宜且易得；3、在一定的条件下数据更加容易比较；4、器官间的分析更加容易。代谢组学在人们的生活中可以得到更为广泛的应用。 随着人们生活水平的提高，老龄化程度的加快，生物医疗越来越引起大家的重视。大家都“谈癌色变”。而有趣的是，最近几年，代谢组学在癌症上的研究越来越多，它已经向我们展示了癌症细胞相对于正常细胞会使代谢产物产生一些外形上的改变，可以帮助我们进行疾病的探测、预测治疗的效果以及新理论的发展。 三、实验目的 运用代谢组学在早期探测疾病，提高预测的准确性，预测治疗效果，推动代谢组学理论的发展。 四、实验设计 简要步骤如下：1、从组织或者细胞中提取代谢产物；2、对于细胞或者组织环境的改变观察代谢物的数量改变；3、数据分析：对于部分研究来说，总体和特殊代谢分析包括相类似的代谢产物提取和分析方法，最常用的就是NMR（核磁共振）、LC/MS（液相色谱/光谱测定）、GC/MS（气相色谱/光谱测定），然后用电脑进行分析数据。 总体研究：Denkert等人使用气相色谱/光谱测定分析卵巢癌代谢在恶性肿瘤和良性肿瘤之间的区别。在他们的研究发现，51钟代谢物(总共291个不同的代谢物)是差异性特别大。他们连接这些代谢物使用的基因、KEGG，检测甘油脂类差异(磷酸甘油,肌醇磷酸盐和葡萄糖-1-磷酸盐),游离脂肪酸（硬脂酸、十七酸等)、氨基酸代谢(脯氨酸、谷氨酸、甘氨酸,γ-氨基丁酸、谷氨酰胺、苏氨酸和天冬酰胺)和能量代谢(苹果酸和反丁烯二酸)。 尿液研究：尿液是经常收集和分析以确定癌症的生物标记。分析尿液的能力对其他的标记物相比是较有利的筛选技术,因为它是完全非侵入性的,并不会对病人造成伤害。它已被证明,分析尿液的个人与乳腺癌和筛查多种生物标志物可以有一个类似的灵敏度传统乳房x光检查,而不用暴露患者x射线。分析尿液生物标记物也可以提供一种便捷的方法来筛选个人癌症,尤其是当癌症是很难屏幕和检测,比如卵巢癌和肝细胞癌。利用尿液代谢筛查和生物标志物识别采用了类似的方法,用于分析其他生物体液的细胞。收集尿液后发病和健康的个体，利用色谱技术，包括气相色谱和液相色谱法，其次是质谱技术，是为了分离和识别代谢物的患病和正常情况下。分析技术用于集群或单独的和正常情况下是用来确定代谢物，用来辨别正常个体和患病的病人。 血液/血清研究：德西尔瓦等人应用核磁共振光谱代谢足迹技术在人类血清脂质代谢产物，用31 p包含衍生化试剂2氯4,4、5、5-tetramethyldioxaphospholane(CTMDP)并取得了高灵敏度和光谱分辨率。这种方法将帮助分析人类血清从而进行疾病的预测。 唾液代谢研究：尽管唾液是一个重要的生物液体，但它没有被广泛地用于研究癌症的诊断。最近,一些科学家对唾液进行代谢足迹技术研究。从患者口腔、乳腺癌、胰腺癌使用毛细管电泳质谱，研究显示胰腺癌患者和健康对照组存在差异：八个代谢物(亮氨酸，异亮氨酸，色氨酸、缬氨酸、谷氨酸、苯丙氨酸、谷氨酸盐和天冬氨酸) 。 五、实验结果 总体分析结果：恶性肿瘤有较高的代谢流动率、供氢氨基酸(谷氨酰胺和谷氨酸,天冬酰胺)和在蛋白质的生物合成中有构建作用的氨基酸(半胱氨酸,甘氨酸和苏氨酸)。Denkert等人进行剖析的正常和代谢物结肠癌组织，发现82种代谢物是明显不同。与柠檬酸代谢周期相比,癌症组织比正常结肠样本要短。更改结肠癌的最重要的代谢物是β-alanine代谢。一些人使用核磁共振和GC / MS发现, 相对良性的肺部组织，肺部肿瘤有碳会是从葡萄糖进入乳酸、丙氨酸、谷氨酸、琥珀酸、柠檬酸和天冬氨酸。正如前面提到的,Warburg效应表明,癌症与细胞线粒体代谢改变或功能失调有关。代谢组学是一个有前途的技术，可以用来揭开良性肿瘤、恶性肿瘤和