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环境微生物的宏基因组学研究进展_陈金华
2010 年第 06 期 吉 林 农 业 NO .06,2010
(总第 244 期) JILIN AGRICULTURAL (CumulativetyNO.244)
环境微生物的宏基因组学研究进展
陈金华
西华师范大学生命科学学院 四川 南充 637002
( , )
在当前的实验室条件下自然界中约有99 的微生物不可培养 这使微生物资源的开发利用受到了限制 宏基因组技
摘要: % , 。
术通过不培养微生物而直接对环境中总DNA进行克隆筛选来突破这个瓶颈 宏基因组技术现在已经用于各种微生态环境的研究中
。 ,
大大加深了我们对环境中的微生物多样性以及微生物功能的认识。
宏基因组 不可培养微生物 筛选系统
关键词: ; ;
Q75 A 1674-0432 2010 -06-0044-3
中图分类号: 文献标识码: 文章编号: ( )
仍然不能说明样品中的所有16S rRNA 基因的微小差异 1% 的
0 引言 (
序列差异 97 种已完全测序细菌全基因组比较表明 它们包
Woese 和Pace 基于16S rRNA 或DNA 基因序列分析的先锋 )。 ,
含242 种属于非同源多操纵子的不同16S rRNA 基因 序列分析
研究工作给微生物生态学领域带来了革命性的变化 在此之前 。
。 ,
人们完全没有意识到真实存在于自然界和在实验室能培养的微 还表明任何基因组中的16S rRNA 内部操纵子的差异在1% 以内。
引入一个修正参数2.5 242 个rRNA 操纵子和97 个基因组相除
生物数量之间重大的差别 伴随着克隆和测序技术的发展 细 ( )
。 ,
到浮游生物样品待测序的序列中 以99% 的相似性 1113 为
菌通用引物对环境中生物群落总DNA 的直接PCR 扩增,产生了 , ( )
标准 Acinas 等预测这些样品中至少包含了446 种紧密相关的
大量的数据并重新定义了原核生物的多样性 近年来一些学者 ,
。
基因组 因此这些数据间接的表明了这个种群内部包含有大量
对微生态学和宏基因组进行了研究 以下是近几年报道的关于
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