互作基因定位方法的研究和计算机软件的开发.pdfVIP

维普资讯 遗 传 HEREDITAS (Beff=frg『】28(10)：1306-1310，2006 技 术 与 方 法 互作基因定位方法的研究和计算机软件的开发 黄伟素 ，郑 燕 ，陈国波 ，吴为人 2 (1．浙江大学农业与生物技术学院，杭州 310029；2．福建农林大学作物科学学院，福州 350002) 摘 要 ：质量性状中存在 6种可能的基 因互作类型，即互补、重叠、累加、显性上位、隐性上位和抑制。在遗传研 究中，有时会遇到互作基 因定位的问题 ，但至今未见有关互作基 因定位方法和计算机软件的系统的研究报道 。文章 给 出了基于极大似然估计的互作基 因定位方法及相应的计算机软件(IGMapping1．0)。计算机模拟表 明，此方法可 以 无偏地估计一个共显性标记与一个互作基因之间的重组率或连锁距离。 关键词：质量性状 ：基因互作；基因定位；IGMapping 中图分类号：Q348 文献标识码：A 文章编号：0253-9772(2006)10-1306-05 StudiesofMethodsandExploitationofComputerSoftware forMappingInteractiveGenes HUANG Wei．Su’ZHENG Yan’CHENGuo．Bo’W U Wei．Ren’，2 ， ， ， f1．CollegeofAgricultureandBiotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310029，China；2．CoflegeofCropSconce FujianAgricultureandForestryUniversiyt,Fuzhou350002，China) Abstract：There are sixpossible types ofgene interaction inqualitative ly，complementary，duplicate， cumulative。dominantepistasis，recessive epistasis and inhibiting．In genetic studies，the problem Ofmapping interactivegenesmaybemetsometimes，butnosystematicresearchesonthemethodologyandcomputersoftwarefor themappingofinteractivegeneshavebeenreporteduptodate．Inthispaper，methodsforthemappingofinteractive genesbasedonmaximum-likelihoodestimationandcorrespondingcomputersoftware(IGMapping1．0)arepresented． Computersimulationshaveshownthatthemethodsproposedcanunbiasedlyestimatetherecombinationfrequencyor linkagedistancebetweenacodominantmarkerandaninteractivegene． Keywords：qualitativetrait；geneinteraction；genemapping；IGMapping 基 因定位是现代遗传学的一项重要研究 内容， 际研究中最为常用[2】。另外，其他一些软件也可用 是基 因克隆和分子标记辅助育种的基础 。对控制质