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土壤微生物生态学研究方法进展_3百替生物.pdf
土 壤 与 环 境 2002, 11(2): 167~171
SoilandEnvironmentalSciences E-mail:ses@
土壤微生物生态学研究方法进展
蔡燕飞,廖宗文
华南农业大学资源环境学院,广东 广州 510642
摘要:土壤微生物研究方法经历了微生物纯培养、土壤酶活性(BIOLOG微平板分析)、微生物库(如微生物生物量)
和流(C和N循环)、微生物生物标记物(FAMEs)、微生物分子生物学技术(从土壤中提取DNA,进行PCR-DGGE、
PCR-SSCP、RLFP分析等),揭示了土壤微生物群落丰富的多样性和生态功能;现代生物技术和传统微生物研究方法的
配合将为土壤微生物学研究提供较好的前景。
关键词:土壤微生物生态;酶;微生物生物量;生物标记物;分子生态
中图分类号:S154.3 文献标识码:A 文章编号:1008-181X(2002)02-0167-05
土壤微生物学最本质的问题是微生物生态学的 生物研究的一个致命弱点是不能直接的反映土壤实
问题。本文旨在对这领域的研究作个回顾,介绍一 际微生物状况。Visser 等对酶检测用于土壤微生物
[5] Skujins(1978)
些新方法,对将来土壤微生物研究作出展望。 群落和土壤质量评价提出了怀疑 。
1 微生物纯培养 认为脱氢酶本身的生物化学特征决定了它不可能以
[6]
传统的土壤生态系统中微生物群落多样性及结 胞外酶状态存在于土壤中 。为了解决土壤酶测定
构分析大多是将微生物进行分离培养,然后通过一 中的评判问题,Beck(1984)提出了土壤微生物如
般的生物化学性状,或者特定的表现型来分析,局 微生物量(microbialbiomass)、还原酶(reductase)、
限于从固体培养基上分离微生物。随着人们对土壤 水解酶(hydrolase)的适宜指标,然而,这些指标
中微生物的原位生存状态研究,越来越发现常规的 从来没有被广泛采用。Beck(1984)和Trasar-Cepeda
etal. 1998
分离培养方法很难全面地估价微生物群落多样性。 ( )认为把酶用于土壤质量评价指标是值
从土壤中简单提取和平板培养计数不能得到土壤微 得怀疑的,而且缺乏常规可行的酶测定手段,存在
,
[1] [7 8]
生物在土壤生态系统中的生活特征和生态功能 的 药品昂贵等问题 。
信息。纯培养方法和原理大多从医药微生物引过来 Community-level physiological profiling (CLPP)
Garland and Mills 1991
的,有些方法对土壤微生物研究并不很适合,譬如 是由 ( )提出的另一种酶分
[9] 95
在自然土壤生态环境下许多土壤微生物处于贫营 析方法 ,微生物群落降解 种不
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