蛋白质序列的矩阵图谱表达.pdfVIP

第 l5卷 第 2期 生命科 学研 究 Vo1．15 No．2 20l1年 4月 LifeScienCeResearch Apr．2011 蛋 白质序列的矩阵图谱表达 张 堑 ，赵静静 ，唐旭清 (江南大学 理学院，中国江苏 无锡 214122) 摘 要 ：基 于经典 HP模 型，利用蛋 白质序 列的矩阵 图谱表达 法 (MGR)及数值刻 画的思想提 出了一种新 的蛋 白质序列的比对方法 ，通过观察蛋 白质序列的数值刻画图及计算两蛋 白质序列之 间的欧氏距 离d，对木聚糖 酶两 家族 的蛋 白质序 列进行 了相似性 分析 ．发现被 划分 为 同一木聚糖 酶 家族 的蛋 白质序 列之 间的相似性 更 大．而且蛋 白质序 列的相似性程度 与分子 大小、结构和分子进化相关． 关键词 ：经典 HP模 型；矩阵 图谱表达 ；相似性 ；木聚糖酶 中图分类号 ：029；TP301；Q71