获取DNA、RNA和蛋白质序列信息.pptVIP

第一章 获取DNA、RNA和蛋白质序列信息 第一节 引言 生物信息学（Bioinformatics） 在生命科学研究中发展起来的一门由分子生物学和计算机信息处理技术相结合，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索、传播、模拟和分析的交叉学科，它利用数据库技术和软件技术对大量积累的生物大分子序列数据和实验测定的序列进行比较和分析，揭示出生物大分子的分子结构、功能和进化关系以及基因组构成与基因表达等生物学事件对生命活动的影响。 生物信息数据库种类 : 基因组数据库、 核酸和蛋白质一级结构序列数据库、 生物大分子（主要是蛋白质）三维空间结构数据库、 以上述三类一次数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。 一次、二次数据库特点 一次数据库的数据量大、更新速度快、用户面广，存在过多的甬余数据。 而二次数据库的容量比较小，更新速度也没有一次数据库那样快，经过筛选后，避免了过多的甬余数据。 根据数据库存储的内容可将生物信息学数据库分为： 核酸、 蛋白质、 基因图谱、 结构、 文献等数据库 第二节 核酸序列数据库 一、GenBank数据库 GenBank 是一个综合数据库，该数据库中包含了已经公开的260000余种不同物种生物的核酸序列，这些数据主要是由全世界不同实验室和大规模测序计划提交给GenBank的。 GenBank是具有目录和生物学注释的核酸序列综合数据库， 由美国国家