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* 聚类分析结束 回到选择? * 聚类分析 * 聚类 俗语说,物以类聚、人以群分。 但什么是分类的根据呢? 比如,要想把中国的县分成若干类,就有很多种分类法; 可以按照自然条件来分, 比如考虑降水、土地、日照、湿度等各方面; 也可以考虑收入、教育水准、医疗条件、基础设施等指标; 既可以用某一项来分类,也可以同时考虑多项指标来分类。 * 聚类分析 对于一个数据,人们既可以对变量(指标)进行分类(相当于对数据中的列分类),也可以对观测值(事件,样品)来分类(相当于对数据中的行分类)。 比如学生成绩数据就可以对学生按照理科或文科成绩(或者综合考虑各科成绩)分类, 当然,并不一定事先假定有多少类,完全可以按照数据本身的规律来分类。 本章要介绍的分类的方法称为聚类分析(cluster analysis)。对变量的聚类称为R型聚类,而对观测值聚类称为Q型聚类。这两种聚类在数学上是对称的,没有什么不同。 * 饮料数据(drink.sav ) 16种饮料的热量、咖啡因、钠及价格四种变量 * 如何度量远近? 如果想要对100个学生进行分类,如果仅仅知道他们的数学成绩,则只好按照数学成绩来分类;这些成绩在直线上形成100个点。这样就可以把接近的点放到一类。 如果还知道他们的物理成绩,这样数学和物理成绩就形成二维平面上的100个点,也可以按照距离远近来分类。 三维或者更高维的情况也是类似;只不过三维以上的图形无法直观地画出来而已。在饮料数据中,每种饮料都有四个变量值。这就是四维空间点的问题了。 * 两个距离概念 按照远近程度来聚类需要明确两个概念:一个是点和点之间的距离,一个是类和类之间的距离。 点间距离有很多定义方式。最简单的是歐氏距离,还有其他的距离。 当然还有一些和距离相反但起同样作用的概念,比如相似性等,两点越相似度越大,就相当于距离越短。 由一个点组成的类是最基本的类;如果每一类都由一个点组成,那么点间的距离就是类间距离。但是如果某一类包含不止一个点,那么就要确定类间距离, 类间距离是基于点间距离定义的:比如两类之间最近点之间的距离可以作为这两类之间的距离,也可以用两类中最远点之间的距离作为这两类之间的距离;当然也可以用各类的中心之间的距离来作为类间距离。在计算时,各种点间距离和类间距离的选择是通过统计软件的选项实现的。不同的选择的结果会不同,但一般不会差太多。 * 向量x=(x1,…, xp)与y=(y1,…, yp)之间的距离或相似系数: 欧氏距离: Euclidean 平方欧氏距离: Squared Euclidean 夹角余弦(相似系数1) : cosine Pearson correlation (相似系数2): Chebychev: Maxi|xi-yi| Block(绝对距离): Si|xi-yi| Minkowski: 当变量的测量值相差悬殊时,要先进行标准化. 如R为极差, s 为标准差, 则标准化的数据为每个观测值减去均值后再除以R或s. 当观测值大于0时, 有人采用Lance和Williams的距离 * 类Gp与类Gq之间的距离Dpq(d(xi,xj)表示点xi∈ Gp和xj ∈ Gq之间的距离) 最短距离法: 最长距离法: 重心法: 离差平方和: (Wald) 类平均法: (中间距离, 可变平均法,可变法等可参考各书). 在用欧氏距离时, 有统一的递推公式 (假设Gr是从Gp和Gq合并而来): * Lance和Williams给出(对欧氏距离)统一递推公式: D2(k,r)=apD2(k,p)+aqD2(k,q)+bD2(p,q) +g|D2(k,p)-D2(k,q)| 前面方法的递推公式可选择参数而得: 方法 ai (i=p,q) b g 最短距离 ? 0 -1/2 最长距离 ? 0 1/2 重心 ni/nr -apaq 0 类平均 ni/nr 0 0 离差平方和(ni+nk)/ (nr+nk) -nk/ (nr+nk) 0 中间距离 1/2 -1/4 0 可变法 (1-b)/2 b(1) 0 可变平均 (1- b) ni/nr b(1) 0 * 有了上面的点间距离和类间距离的概念,就可以介绍聚类的方法了。这里介绍两个简单的方法。 * 事先要确定分多少类:k-均值聚类 前面说过,聚类可以走着瞧,不一定事先确定有多少类;但是这里的k-均值聚类(k-means cluster,也叫快速聚类,quick cluster)却要求你先说好要分多少类。看起来有些主观,是吧! 假定你说分3类
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