喀斯特炭疽菌TaqMan探针实时荧光PCR检测方法的建立.pdf

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贵州农业科学 2017,45(2):5~9 GuizhouAgriculturalSciences [文章编号]IOOI一3601(2017)02—0042—0005—05 喀斯特炭疽菌TaqMan探针实时荧光PCR检测方法的建立 孙 涛 一,孔德英 ,滕少娜 。,邓朝晖 。 (1.重庆出入境检验检疫局,重庆 400020;2.国家中药材物种鉴定及质量安全检测重点实验室,重庆 400020) [摘 要]为寻求喀斯特炭疽茵的快速检测方法 ,利用TaqMan探针实时荧光定量 PCR技术 ,以喀斯特 炭疽茵基 因组 中的ACT基 因为靶序列设计并筛选特异性 引物探针 ,通过特异性、灵敏度、重复性试验建立 喀斯特炭疽菌TaqMan探针实时荧光 PCR检测方法。结果表 明:建立方法的特异性较强、灵敏度较高、重复 性稳定性较好,最低检测限为0.2PgDNA/反应,标准曲线的线性关系 良好 ,相关系数为 0.998。该方法操 作简便 ,可用于进 出境 口岸喀斯特炭疽茵的检疫。 [关键词]喀斯特炭疽菌;检疫 ;鉴定 ;TaqMan实时荧光 PCR [中图分类号]$41~30 [文献标识码]A EstablishmentofaTaqManrea1.time POR TestMethodfor Detecting Colletotrichum karstif ’ SUN Tao一,KONG Deying”,TENG Shaona ,DENG Zhaohui (1.ChongqingEntry—ExitInspectionandQuarantineBureau,Chongqing400020;2.StateKeyLaboratoryof ChineseHerbajMedicineSpeciesIdentificationandQualitySafetyTesting,Chongqing400020,China) Abstract:TheTaqM an real—time fluorescencePCR detection methodofColletotrichum karstiiwas establishedbyusingtheTaqManreal-timefluorescencequantitativePCR technology,takingACT geneas thetargetand screening specificprimersand probeafter specificity,sensitivity andrepetition teststo exploretherapiddetectionmethodofColletotrichum karstii.Results:Theminimum detectionlimitofthe establishedTaqM anreal—timefluorescencePCR detectionmethodwithstrongspecificity,highsensitivity, stablerepeatability,goodlinearrelation (0.998)andsimpleoperationiS0.2PgDNA,whichindicatesthe establishedTaqM anreal—timefluorescencePCR detectionmethodcan beused in Colletotrichum karstii; quarantineatentry—exitports. Keywords:Colletotrichum karstii;quarantine;identification;TaqM anreal—timefluorescencePCR 炭疽菌属 (Colletotrichum)真菌是一类全球分 适生性强 ,可通过带病种苗、花卉、果实等进行远距 布的植物病原菌 ,其寄主范围极广 ,包括豆科 、十字 离传播 ,对我国果树 、蔬菜和园林植物的生产和生态 花科、茄科等几十个属 的几百种植物 ,能侵染寄主植

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