第三讲化学结构绘图.ppt

第三讲 化学结构绘制软件ACD/ChemSketch;一、ACD/ChemSketch基础;1.启动ACD/ChemSketch;2.设定可兼容的文件类型;3. ChemSketch的工作界面;结构模式的工作界面; ChemBasic 功能键(ChemBasic toolbar) -在一般功能键的下面, 它们是可选功能, 包括附件和其他 ChemBasics 的功能（免费版无此项）。 结构模式功能栏(Structure toolbar)只有结构模式有这些功能键, 包括画化学结构和相关功能. 原子功能键(Atoms toolbar)包括原子名称和改变原子性能的键(电荷, 电子层等). 参考功能键 (Reference toolbar) 可以从此处进入ACD字典. 工作区域(Workspace) 结构式将在这里显示. 调色板(Color Palette)用来将原子和化学键等涂上颜色(只要在相应的颜色上点击既可). 状态栏(Status bar)-显示对当时状态有用的信息: 打开的SK2文件名, SK2文件的页码, 化学结构的分子式, 以及化学结构的一些性质。;标题栏(Title bar) 菜单栏(Menu bar) 通用工具条(General toolbar)同结构模式。 编辑工具条(Editing toolbar) – 位于通用工具条的下面, 只适用于画图模式,包括编辑动画物体的功能键. 画图工具条(Drawing toolbar)包括画各种物体和文字的功能键. 工作区域(Workspace)- 在中间的区域, 图画与文字将在这里显示. 调色板(Color Palette) 用来将物体等涂上颜色,(只要在相应的颜色上点击即可). 状态栏(Status bar) -显示对当时状态有用的信息: 打开的SK2文件名和 SK2文件的页码等. ;二、画简单的结构;1．使用常用画图工具;例2 （双键和三键）;注：（1）删除原子 如果增加了过多的原子, 可以逐一去除原子，点击Delete 键.使用Delete 键也可以将整个分子清除，先在空白处单击选中整个分子（或用套索工具选中） ，然后在分子上单击。点右键可取消删除状态。 （2）恢复键(Undo) 另外一个重要的功能是如何恢复以前的界面设置: 单击Undo键 。这会将ChemSketch的界面恢复到以前的设置（ 点击 Undo键将会激活重做(Redo)键） Undo键可以连续点击50次.当画比较复杂的结构或者物体时, 要养成及时保存文件的习惯file/save.;;2．使用连续画图工具;拖动鼠标画图 在正常画图(Draw Normal)和连续画图(Draw Continuous)两种模式下，可以从一个原子拖动鼠标到另一个原子，画出单键。如果从一个空白处开始(或结束)拖动，将在开始处(或结束处)生成一个新的原子。在下面结构中，点击一端的碳原子，拖动鼠标到另一端的碳原子。 → 使用“清洁” (Clean)命令（2D 优化） 点击结构工具栏中“清洁” 命令 ，将使结构中所有的键长与角度平均化。 注意： Clean命令不仅使键长和角度平均化，令结构看上去更好看，且使该结构更符合化学意义。;3.使用立体键、配位键和非定义化学键工具;4．编辑原子标签;5．使用画链工具;6.翻转结构;7.选择、旋转和3D旋转;清理屏幕 可以通过以下操作来清理屏幕： 在文件菜单中选择“新文件”(New)，创建一个新的文件。 在左上方选择创建新页按钮(New Page) ，创建新的一页。 在编辑菜单中选择“全选”按钮(Select All)，使用键盘上的“删除”命令(Delete)。 在工具栏中(General toolbar)点击删除(Delete)按钮，点击空白处，再点击结构的任意部分，将其全部删除。 注意： 在结构模式(Structure model)中，这种方式只能删除化学结构。要删除图象，请转换到画图模式(Draw Model)。;三、画复杂的结构;1、如何用化学基团表画化学基团;2、如何迅速地画环结构;3、如何画原子的电荷、阳离子和阴离子;4、如何改变不同原子???性能;还有另外两个标签，Common 和Bond