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QExactive在蛋白质鉴定和定量中的应用
应用文献
Note:CM0072 Q Exactive在蛋白质鉴定和定量中的应用
李静 叶芳挺
赛默飞世尔科技(中国)有限公司色谱质谱部 201206
1 前言 梯度:
Q Exactive是赛默飞世尔科技在2011年ASMS上推出 Time Composition
的新型四极杆和轨道阱杂交高分辨质谱仪,它将高选 0.00(min) A=100.0% B=0.0%
关键词: 择性四极杆的离子过滤与Orbitrap高分辨准确质量数 80.00(min) A=65.0% B=35.0%
·
Q Exactive (HR/AM)测量技术相结合,在分辨率、扫描速度和灵敏 95.00(min) A=0.0% B=100.0%
· 度性能上进一步提升,并提供各种高分辨扫描功能,适 100.00(min) A=100.0% B=0.0%
Orbitrap
应不同的应用需要。 120.00(min) A=100.0% B=0.0%
·
TMT
Q Exactive作为蛋白组学研究的一个通用质谱平台, 流速:300 nL/min
·
Proteome 可以同时涵盖蛋白质组学的定性和定量要求,并能够 2.2质谱方法
Discoverer 在一台仪器上同时达到高灵敏度、高分辨率、高质量 质谱仪:Q Exactive
准确度和高质谱图采集速度。 喷雾电压:1.8 kV
同量异序化学标签 (如Thermo Scientific 串联分子量 毛细管温度:200 °C
标签,T MT )是 目前常用的一种同位素标记相对定 全扫描分辨率:70,000
量技术,在MS/ MS水平依据报告离子的强度进行定 MS/MS分辨率:17,500
量。Q Exactive所采用的高能碰撞诱导解离 (HCD) 母离子扫描范围:300-1800 m/z
非常适宜TMT定量研究,高达12HZ 的采集速度也大 碰撞能量:30% HCD
大提高了蛋白质鉴定的效率。本实验
考察了Q Exactive在蛋白质鉴定和TMT定量方面的具 2.3数据库检索
体应用,从鉴定数 目、谱图质量、定量结果等方面进 数据采用Proteome Discoverer1.3进行检索,搜索使
行评价。 用的蛋白质数据库ipi.MOUSE.v3.82.fasta 。
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