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中国动物传染病学报 　2009 ,17 (3) :27 - 32 　 Chinese J our nal of Animal Infectiou s Di sea se s ·研究论文 · 犬细小病毒上海分离株全基因的克隆及进化树分析 1 ,2 1 ,2 2 2 2 2 1 郭 　伟 ,商晓桂 ,单同领 ,华修国 ,杨志彪 ,朱建国 ,周雨霞 (1. 内蒙古农业大学动物医学与科学学院 ,呼和浩特 010018 ;2 . 上海交通大学农业与生物学院 ,上海 200240) ( ) 摘 　要 : 为研究上海地区犬感染细小病毒 Canine p arvoviru s ,CPV 的基因特点和基因型 ,参考 GenBank 上细小病 毒 3 个基因型的全基因设计 6 对扩增引物进行 PCR ,分段扩增出目标片段 ,克隆于 T 载体上 ,测定序列并拼接 ,用 M E GA 软件 、NJ 法构建进化树 。结果显示 ,犬细小病毒全基因为 4 758 bp ,命名为 CPVSH ,提交到 GenBank 上的 序列号为 FJ 792 845 ,与 GenBank 中4 种基因型犬细小病毒的 V P2 基因核苷酸序列同源性比较发现 ,CPVSH 克隆 与 2a 亚型犬细小病毒核苷酸同源性为最高 99 . 7 % ,与 2 型 、2b 亚型 、2c 亚型的同源性分别为 98 . 8 % 、99 . 5 % 、99 . 5 % 。CPVSH 属于 2a 亚型犬细小病毒 ,与国内北京分离株 CPV/ BJ 082 亲缘关系最近 , 同源性为 99 . 9 % 。 关键词 : 犬细小病毒 ; 上海 ; 2a 基因亚型 ; 进化树分析 中图分类号 : S858 . 292 . 265 . 292 　　　　文献标识码 : A 　　　　文章编号 : 1674 - 6422 (2009) 03 - 0027 - 06 COMPL ETE GENOMIC SEQUENCE ANALYSIS OF A SHANGHAI LSOLATE OF CANINE PARVOVIRUS GU O wei1 ,2 , SHAN G Xiaogui1 ,2 , SHAN Tongling2 , HU A Xiuguo2 , YAN G Zhibiao2 , Z HU J ianguo2 , Z HOU Yuxia1 ( 1 . Col leg e of A ni m al S cience an d Vete ri n a ry M e d ici ne of I nner M ong ol i a A g ric ul t u ral Uni ve rs i ty , H u h hot 010018 , Ch i na; 2 . S chool of A g ricu l t u re an d B iol og y , S h ang h ai J i ao Tong Uni ve rs i ty , ) S h ang h ai 2 00240 , Ch i na Abstract : To st u dy t he geno mic or ganization an d genot yp e of a Shan g