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生物信息学自由软件开发项目Biopython.pdf
生物秀—专心做生物！
Software review
The Bio toolkits – a
brief overview
Abstract
Bioinformatics research is often difficult to do with commercial software. The Open Source
BioPerl, BioPython and BioJava projects provide toolkits with multiple functionality that make
it easier to create customised pipelines or analysis. This review briefly compares the quirks of
Keywords: Bioperl,
the underlying languages and the functionality, documentation, utility and relative advantages of
BioPython, BioJava,
bioinformatics, comparison, the Bio counterparts, particularly from the point of view of the beginning biologist
open source programmer.
This article is directed to the beginning The same idea gave birth to the
bioinformaticist or biologist thinking of BioPython and BioJava groups in 1999
learning a programming language to help and the BioCORBA and BioDAS have
2
with their work. If you are familiar with been added since. The BioRuby,
Perl, Python or Java, your decision is BioLisp3 and B4 groups
probably already made, based on your share a similar vision and are worth
cur
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