生物技术专业学生数据处理技能的培养.pdfVIP

第 30 卷 第 4 期 高 师 理 科 学 刊 Vol. 30 No.4 2010 年 7 月 Journal of Science of Teachers′College and University Jul. 2010 文章编号：1007-9831（2010）04-0108-03 生物技术专业学生数据处理技能的培养 孙婴宁，李波，王维禹，焦德志 （齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院，黑龙江 齐齐哈尔 161006） 摘要：结合现代教育技术与教学实践，探讨了生物信息学理论教学与实验教学的基本教学思路和 具体应用方法．培养了学生生物信息数据处理技能，提高了学生解决实际应用问题的能力． 关键词：应用型人才；数据处理；生物信息学 中图分类号：Q811．4∶G642．0 文件标识码：A doi：10．3969/j．issn．1007-9831．2010．04．032 自人类基因组计划的完成以来，生命科学进入到高速飞跃发展的时代，产生了大量的生物数据．生物 数据除了具有海量特征外，更有其独特的复杂性[1] ．能否对生物学数据进行处理和释读是上个世纪生物方 面质疑的焦点问题之一．这一问题提出的同时，计算机技术开始迅猛发展，从而使得基因组和其他生物学 研究所产生的海量数据才能够有效地加以管理和应用，生物信息学（Bioinformatics，BI）这门学科也藉此 得以形成并飞速发展．BI 是利用人工智能和计算机对核酸序列和蛋白质结构数据等生物信息进行储存、检 索和分析的一门学科[2] ，研究内容包括对海量数据的收集、整理与服务，以及从数据中发现新的规律．自 从 1987 年出现 Bioinformatics 一词以来，生物学的重点和潜在的突破点已经由 20 世纪的实验分析和数据积 累，转移到数据分析及其指导下的实验验证上来[3]．BI 所提供的研究工具对生物学发展至关重要，因此 BI 成为生物技术应用型人才必须掌握的现代知识，数据处理技能也成为生物技术专业人才的必备技能．为此， 在教学实践中对 BI 的课程设计、理论与实验课堂教学等方面，进行了积极地探索． 1 BI 理论课的教学侧重于应用 生物技术专业 BI 是一门专业方向限选课，总课时为 32 学时，根据选修学生的专业知识基础和计算机 应用能力状况，将授课内容分为理论基础和实验上机操作部分．其中理论基础课为 20 学时，实验课 12 学 时．BI 是一门应用信息技术解决生物学问题的学科，教学目的是使生物技术专业学生具备一定的生物数据 处理技能．因此这门课程在进行理论课的教学时，以数学模型和编程算法为辅，主要强调实际操作，便于 学生根据自己的发展计划和需求做出合理选择．课程选用多媒体教学，不仅要传授理论知识，更重要的是 把实际操作演示给学生．把主要的核酸和蛋白序列数据库的功能、检索技术、应用技巧和软件使用的具体 操作，逐步通过幻灯片清晰地反映出来，使学生能够直观地接触所学知识．例如：在介绍各种序列比对工 具时，简单介绍 Blast，FASTA 2 种软件的原理与计算方法，重点是将这 2 种软件进行横向比较，将其各自 的特点、优势和适用范围详细介绍，并且加以区分．注重课堂知识与实践的紧密结合，经常举出一些实际 生产与研究中经常遇到的有关数据处理的应用实例，讲解解决问题的技巧和方法、步骤．训练学生解决问 题的思想意识，增强学生解决实际应用问题的能力，将所学知识能够做到学以致用． 2 优化 BI 实验课教学 生物技术专业学生数据处理技能的锻炼主要是在 BI 实验课上，因此 BI 实验课的教学对于该技能的培 收稿日期：2010-02-20 基金项目：黑龙江省高等学校新世纪教学改革工程项目（2009）；齐齐哈尔大学教育科学研究项目 作者简介：孙婴宁（1981-），女，辽宁抚顺人，讲师，硕士，从事生物信息学、细胞生物学研究．E-mail：progress123@1