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在GaussView5.0中利用对称性画二茂铁的分子结构图
Example: 二茂铁分子
Software: Gaussview 5.0
1. 在GaussView的视窗中按五边形大致画出五个C原子
2. 点击Edit/Point group… , Enable Point group symmetry
3. Symmetrize D5h或者较低的对称性, 然后constrain to subgroup to 最高对称性D5h
4. 调整(Modify Bond)C-C键为1.44 angstrom
5. 添加H原子: 点击Build Fragment的下三角, 点选Custom Mode下的”Bond to Target Atom Instead of Deleting It”, 这样才能顺利添加C-H键;设置C-H键为1.07 angstrom
6. 将画好的环戊烷分子复制粘贴一个,大致调整两个分子的间距
(Alt+鼠标左键点在单个分子上,只转动这个分子; Alt+鼠标中键点在单个分子上,只平动这个分子; Alt+Ctrl+鼠标左键点在单个分子上,绕垂直于屏幕的方向转动这个分子)
7. (把这两个分子constrain point group to D5h, ) 调整分子使两个分子交叉重叠, 然后constrain point group to D5d;
8. 选定所有原子，再选定要添加的Fe原子, 右键中选Build, Place Fragment at centroid of selected atoms;（GaussView5.0新增加功能）
9. 调整(Modify Bond)C-C键为2.10 angstrom;
10. Done!
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