长链非编码RNA及其生物学功能概述.pdf

· 2· 生物学教学2017年(第42卷)第2期 长链非编码 RNA及其生物学功能概述 李法君 (山东省潍坊科技学院 262700) 摘 要 长链非编码 RNA(IncRNA)是一类转录本长度超过 200个核苷酸的RNA，可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平对 基因的表达进行调控。本文综述lncRNA的序列特征、分类、来源、作用机制、功能 ，以及其与癌症的关系，为深入探索 lncRNA在生 物体中的功能与调控机制提供基本资料。 关键词 长链非编码 RNA 基因组 癌症 生物学功能 真核生物基因组由数量众多的DNA序列组成， ⑤基因中插入一个全新 的转座 因子而产生有功能的 DNA转录成RNA并翻译成蛋白质，以此进行生物信息 lncRNA。 的传递。研究表明，人类基因组中仅有 1．5％的DNA 2 lncRNA的生物学功能及作用机制 序列用于蛋白质的编码。然而，有趣 的是研究人员发 2．1 生物学功能 研究表明，IncRNA以顺式或反式 现至少有90％的基因组 DNA被转录成 RNA。进一步 作用的方式与核酸分子 (DNA或 RNA)和蛋 白分子相 的研究确认 ，这些序列被转录成非编码 RNA(non— 互作用，参与细胞内的多种生物学过程。具体而言，ln— codingRNA，ncRNA)，其 中tRNA和rRNA已为人熟 cRNA通过染色质重塑、组蛋 白修饰和RNA代谢等多 知，其余 的ncRNA则被视为转录过程中的 “暗物质”未 种生化途径在表观遗传水平、转录水平和转录后水平 被重视。依据片段大小 ，ncRNA又分为短链非编码 对基因的表达进行调控。 RNA和长链 非编码 RNA(1ongnon—codingRNA，In． 2．1．1 表观遗传水平的调控 表观遗传学是指在不 cRNA)。人们最初认为 IncRNA是转录过程 中产生的 改变生物体 DNA序列的前提下，通过对基因的修饰 “噪音”_lj，是基因组在进化过程 中产生的 “垃圾序 (如甲基化)来调控基因的表达。这些修饰包括染色 列”。但是近来的研究证实，lncRNA参与了染色质重 体重塑、基因组印记和x染色体失活等。lncRNA一方 塑、组蛋白修饰和 RNA代谢等多个重要 的生物学过 面可以直接与染色质结合并与其相互作用，从而沉默 程，已成为基因组功能研究的热点领域。 或激活 目标基因；另一方面也可以通过修饰组蛋白来 1 lncRNA的序列特征、分类及来源 沉默 目标基因，同时还可以募集染色质修饰抑制因子 lncRNA最早于2002年发现于小 鼠的全长 cDNA 来参与等位基因的特异性沉默l 。动物体肝脏中的 文库中l2j，其后科研人员将转录本长度超过 200个核 辅酶 II依赖性视黄醇脱氢／还原酶 (DHRS4)基因可以 苷酸的非编码 RNA命名为lncRNAL 。目前发现的多 编码重要 的代谢酶，DHRS4基 因的反义转录 lncRNA 数lncRNA由RNA聚合酶II转录生成 ，虽然 lncRNA缺 (AS1DHRS4)可以募集DNA 甲基化转移酶 (DNMT3a)， 乏开放阅读框，没有编码蛋 白质 的能力 ，但部分 1n． 使DHRS4基因的第二个拷贝(DHRS4L2)基因启动子序 cRNA具有与mRNA相似的序列特征：5端帽子、3端 列中的 CpG 岛甲基化，令 DHRS4L2基 因的转录失 多聚腺苷酸尾、外显子 、内含子和剪接位点等序列特 活 J。研究表明，失活 x染色体特定转录 (Xist)基因 征 [ 。 和Xist的反义序列(Tsix)在x染色体失活过程中发挥 根据 lncRNA编码序列与蛋 白质编码基因的相对 重要作用 ，被活化的 x染色体生成 Tsix，它可以募集 位置，可将 lncRNA分为5类 【j：①正义 lncRNA转录