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第五章_χ2检验
卡方检验的原理与方法;适合性检验;独立性检验 回顾:总体与样本方差公式 例:有一鲤鱼遗传试验,以红色和青灰色杂交,其F2代获得不同分离尾数,问观测值是否符合孟德尔3:1遗传定律. 本例为判断典型的两组数据的适应性检验 (1)H0:鲤鱼体色分离符合3:1, HA:不符. (2)确定显著水平α=0.05 (3)计算χ2:由于理论资料k=2,df=2-1=1,需要进行连续性矫正. 假设H0正确时,青灰色E1和红色E2理论数: E1=1602×3/4=1201.5 E2=1602×1/4=400.5 将数据代入公式得: (4)查χ2值表,当df=1时, . 故应应否定H0,接受HA.即认为鲤鱼体色F2分离不符合3:1比率. SPSS的适合性检验 课堂练习 P83 例5.2 P83 例5.3 数据在chapter 4-2008 P86 例5.4 的SPSS处理 计算χ2值:由于df=(r-1)(c-1)=(2-1)(2-1)=1,故所计算的χ2值需进行连续性矫正: 193(T) 71(C2) 122(C1) 总数 98(R1) 95(R2) 40(36.05) 31(34.95) 58(61.95) 64(60.05) 口服 注射 总数 无效 有效 给药方式 4.查χ2表,当df=1时, χ20.05 =3.841,而χ2c =0.863< χ20.05 , P>0.05,应接受H0 ,拒绝HA ,说明给药方式与给药效果相互独立. 2 × 2列联表的χ2检验可利用以下简式而不必计算理论次数: T/2-为矫正数 193(T) 71(C2) 122(C1) 总数 98(R1) 95(R2) 40 31 58 64 口服 注射 总数 无效 有效 给药方式 1、任何一组的理论次数Ei 都必须大于5,如果Ei ≤5,则需要合并理论组或增大样本容量以满足Ei >5 2、在自由度=1时,需进行连续性矫正,其矫正的χ2c为: χ2= ∑ ( Oi-Ei - 0.5 )2 Ei χ2检验的注意事项 χ2分布是连续型变量的分布,每个不同的自由度都有一个相应的χ2分布曲线,所以其分布是一组曲线。 由于检验的对象-次数资料是间断性的,而χ2分布是连续型的,检验计算所得的χ2值只是近似地服从χ2分布,所以应用连续型的χ2分布的概率检验间断性资料所得的χ2值就有一定的偏差。 由次数资料算得的χ2均有偏大的趋势,即概率偏低。当df=1,尤其是小样本时,必须作连续性矫正。 χ2c = ∑ ( Oi-Ei - 0.5 )2 Ei 比较观测数与理论数是否符合的假设检验(compatibility test),也称吻合性检验或拟合优度检验(goodness of fit test).。 适合性检验 定义 第二节:适合性检验 用 途 1 判定样本实际分布与理论分布是否相等 泊松分布 适合性检验的df由于受理论值的总和等于观测值总和这一条件的约束,故df=n-1 正态分布 二项分布 (1) H0:本资料服从泊松分布 ;HA:本资料不服从泊松分布 300个单位容积内的细菌计数结果如下表,问此资料是否服从泊松分布? 4.44 300 1.000000 300(n) 合计 4.2 0.013911 3 7 0.01 8.2 0.027445 9 6 1.16 19.8 0.066134 15 5 0.12 39.8 0.132798 42 4 0.56 64.0 0.213331 70 3 0.62 77.1 0.257025 84 2 1.92 61.9 0.206446 51 1 0.05 24.9 0.082910 26 0 理论频数E 概率 观察频数O 单位容积内细菌数X (2)取显著水平α=0.05 (3)计算统计数χ2 : (4)查χ2值表,当df=7-2=5时,χ20.05 =11.07。现实得χ2 =4.44<χ20.05 ,故接受H0 ,拒绝HA ,即认为本资料服从泊松分布 。 1602 99 1503 F2观测尾数 总数 红色 青灰色 体色 用它来检验实验结果是否符合各种规律. 用 途2 自由组合定律 孟德尔分离规律 由于上例给出的是频数值,因此要先用Weight Cases对话框指定频数变量 在遗传学中,有许多显、隐性比率可以划分为两组的资料,如欲测其与某种理论比率的适合性,则χ2值可用下表中的简式进行计算: χ2计算公式 理论比率(显性:隐性) 检验两组资料与某种理论比率符合度的χ2值公式 1:1 2:1 3:1 15:1 9:7 r:1 r:m 大豆花色遗传试验F2观测结果 289 81 208 F2观测株数 总数 花色 例 (1) H0 :大豆花色
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