基于新一代测序技术的动植物研究科研思路.pptx

;测序技术发展史; ;;DNA 水平;家鸡基因组;我们准备好了 ……;SOAP de novo;全基因组测序的研究;;;第二代测序技术具有高准确性，与传统的测序结果 基本相同;案例2—印度跳蚁和弓背蚁的基因组文章;基因组差异比较;基因可变剪切;基因家族进化;红火蚁;蚂蚁种类;研究思路比较;Genome sequence of the palaeopolyploid soybean;栽培大豆的基因组;野生大豆基因组;野生大豆与栽培大豆的进化关系;全基因组测序的研究;;; 从寻找外显子、非编码RNA、miRNA、转录因子和miRNA基序等多个角度，发现多重比较策略在比较基因组学研究中效果优于成对比较。; ;大量物种已测序完成，接下来我们能利用这些丰富的基因组资源做什么？ ;;全基因组重测序 简化基因组 目标区域捕获重测序 SNP芯片分型; 全基因组???测序;DNA ;NimbleGen平台;用户自定义芯片; 重测序研究的运用;SNP具有密度高，分布均匀的优点。通过对具代表性的个体进行重测序可以快速、高效、低成本的开发大量的SNPs、为遗传图谱构建以及全基因组关联分析提供大量的标记。;1.1 有参考基因组，简化基因组文库开发SNP;;1.2 无参考基因组，简化基因组文库 de novo 测序开发S