专题2数字标本馆与生物多样性信息管理.PDFVIP

专题 2 数字标本馆与生物多样性信息管理 中国虚拟植物标本馆标本集成检索系统设计与开发 陈建平 （西北农林科技大学生命学院植物标本馆，西安杨凌 712100） 集成检索，也称为元检索、集成检索、跨库检索、并发检索、广播检索、联邦检索等。 是一种分布式异构数据库间的系统集成技术。 “中国虚拟植物标本馆集成检索系统”是由中国虚拟植物标本馆 CVH 支持的一个探索性项 目。旨在通过统一的检索界面，同时对多个标本馆的标本数据库进行检索，并将检索结果归 并，一次提交给用户，在实体资源分散的情况下实现了“虚拟的资源整合”。 由于国内各植 物标本馆数据基本都交与 CVH 作数据集中式集成，本项目则主要致力于国外标本馆的数据集 成，采用分布式的虚拟集成策略。 实现方案有两种： 1. 在线多代理方式：它向用户提供统一的检索接口，将用户的检索要求转化为不同数据源 的检索表达式，并发地检索本地的和广域网上的多个分布式异构数据源，并对检索结果加以 整合，在经过去重和排序等操作后，以统一的格式将结果呈现给用户。其特点是： ● 能及时反映数据源最新情况。 ● 系统仅有程序，无需数据库，部署方便简单。 ● 无须处理具体数据库，工作量小。 ● 因为所有过程都需要在线处理，所以响应速度慢，服务器压力大。 ● 检索系统受限于各个标本馆的网络服务状况，对方网络地址变更、应用系统更新、服 务器关闭等等情况都会引起检索无效。 ● 查询结果的集成度低。因为数据源返回的结果往往都是分成多页的，在线处理时不可 能等到所有数据后再分析、综合。 2. 搜索引擎方式：先使用网络机器人（Robot，或称为网络爬虫 Spider）缓冲数据源，其 次对数据源进行分析，最后重建索引数据库，建立检索系统。在标本集成检索系统中，系统 将按照物种词典预先检索各个数据源，将结果处理后缓冲在本地。接受用户检索请求后直接 在本地执行检索，返回数据。特点是 ●响应速度快。 ●查询结果的集成度高。可以按照任意的要求对数据进行整理排序。 ●不受数据源的网络状况、服务器错误等意外情况干扰。 ●节省带宽资源，服务性能好。 ●不能反映数据源最新情况，只适用于数据变化周期较长的情况。需要定期更新缓冲。 ●需要分析每个数据源，作数据抽取的工作，工作量大。 目前的系统按照第一种方案设计，即“在线多代理方式”，已经可以检索数十个数据源。 也实现了.NET 平台下的网站自动登陆模块，代理访问模块。同时我们也对第二种方案（即 搜索引擎方式）进行了研究，开发出了 Spider、网页数据分析提取工具等核心工具。 一个生物标本地理信息系统的设计和实现 Design and Implement of a Specimen-Geographical Information System 张尚武 （中国科学院动物研究所，北京 100080） 作者在调查 GIS 技术在生物多样性研究领域的应用时发现，现有的 GIS软件功能复杂， 价格昂贵，仅适合既具备一定 GIS 专业知识又具有计算机技术相关知识的研究人员使用。这 使得生物多样性研究的人力和物力成本大幅增加。而作为发展中国家的中国在生物多样性研 究领域的投入有限，使得 GIS 技术在我国生物多样性研究领域上的应用滞后于国际同行。另 一方