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集群简单装备
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HYPERLINK /educast/article/details/7165235 集群中MPI简单配置
2011-12-30 15:28?127人阅读? HYPERLINK /educast/article/details/7165235 \l comments 评论(0)? HYPERLINK javascript:void(0); \o 收藏 收藏? HYPERLINK /educast/article/details/7165235 \l report \o 举报 举报
一、集群和Linux上的集群解决方案
集群计算机是指用一组联网的PC或工作站来搭建成的,提供比单个PC(节点)计算性能高得多的计算机。说其是计算机,其实是针对所提供出来的服务而言的, 或者说是逻辑上来说的。集群计算机的主要优势就是成本,相同的计算能力下,其成本只有传统大型机的十分之一,在全球计算机TOP500中,集群计算机的比 重越来越大,近两年的比重超过了80%。特别是对中小企事业应用,实验研究和教学有很大的竞争力。集群系统(Cluster)主要解决下面几个问题:1.高可靠性(HA)。利用集群管理软件,当主服务器故障时,备份服务器能够自动接管主服务器的工作,并及时切换过去,以实现对用户的不间断服务。2.高性能计算(HP)。充分利用集群中的每一台计算机的资源,实现复杂运算的并行处理,通常用于科学计算领域,比如基因分析,物理与化学分析等。3.负载平衡。即把负载压力根据某种算法合理分配到集群中的每一台计算机上,以减轻主服务器的压力,降低对主服务器的硬件和软件要求。在实际应用中,最常见的情况是利用集群解决负载平衡问题,比如用于提供WWW服务。在这里主要展示如何使用LVS(Linux Virtial Server)来实现实用的WWW负载平衡集群系统关于集群计算机的操作系统,在TOP500中现在主要的操作系统都有身影,但是应用最多的是LINUX操作系统。这首先利益于LINUX的开放源代码,使得其有很高的可制定性,可以根据不同的硬件和应用环境作出相应的修改,其次,LINUX也有很高的稳定性,而且不乏商业支持。为了降低程序开发的难度和提高程序的可移植性,目前基于LINUX的集群计算环境主要是通过配置MPI(Message Passing Interface)环境可实现的。这也是目前比较成熟的应用模式。因此,本文主要讲解LINUX下的集群环境配置的要求和MPI的配置。LINUX集群环境的配置主要有以下几个部分:1. MPI并行计算环境的安装和配置2. 计算节点之间的无密码访问3. NFS共享文件系统的配置//注:在集群配置过程中,MPI运行环境的安装和配置是必要的,至于计算节点之间的无密码访问和NFS共享,则是在运算效率和文件管理上对高性能计算提出的要求。一般来说,只要具有MPI运行环境可以运算并行计算。二、linux集群中MPI的并行计算环境的简单配置?MPI的安装及简单测试?MPI有多种实现版本,如MPICH, CHIMP以及OPENMPI。其中MPICH是一种最重要的MPI实现,它可以从网上免费获得Linux和Windows版本。它的开发和MPI规范的制定是同步的,因此最能反映MPI的变化和发展,MPICH由此成为实现MPI的最成熟和最广泛使用的版本。本文安装的MPI软版本为MPICH-1.2.6。?安装步骤:?1、从网上下载MPICH压缩包(mpich.tar.gz)?2、解压:# tar zxvf mpich.tar.gz?3、进入解压后的目录: # cd mpich-1.2.6?4、配置: # ./configure –prefix=/usr/local/mpich?其中/usr/local/mpich为软件所安装的目录?5、编译 # make?6、安装 # make install?7、配置该软件的用户搜索路径?Root 用户下:修改/etc/profile 加入?PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin?MANPATH=$MANPATH:/usr/local/mpich/man?Export PATH MANPATH?普通用户下:修改~/.bash_profile 加入?export PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin?8、修改/usr/local/mpich/share/machines.LINUX文件,加入集群中可以用来做并行计算的主机名(八节点集群为例)?加入的内容为:?Local:4Node11:4Node22:4(注:冒号后为节点的CPU数或者内核数)9、MPI环境的简单测试?在服务器节点上,以mpich
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