9.蛋白质的生物合成.pptVIP

9.5.3 原核生物肽链合成的终止 在肽链的延伸过程中，当终止密码子UAG，UAA或UGA出现在核糖体A位时，没有一个tRNA能够与终止密码子相结合，而是靠特殊的蛋白质因子即释放因子（Release factor, RF）促成终止作用。RF在GTP的存在下识别终止密码子，结合在A位点上。RF的结合使得肽基转移酶的水解酶活性被激活，催化P位点上的tRNA与肽链之间的酯键水解，这时，多肽链的合成终止，新生的肽链和最后一个非酰基化的tRNA从核糖体P位点上释放，70S核糖体解离成50S、30S亚基，再进入新一轮的多肽合成（图9-14）。 * 当终止密码子进入核糖体上的A位点后，即被释放因子识别。RF1识别UAA和UAG，RF2识别UAA和UGA。RF3不识别终止密码子，但能激活另外两个因子。RF-3是一种依赖于核糖体的GTPase，结合GTP，帮助其他两种RF因子结合于核糖体。RF-3具有类似于EF-Tu-tRNA-GTP三元复合物的蛋白质部分的结构，RF-1和RF-2类似于tRNA的结构和大小。所以，RF-1和RF-2与tRNA竞争结合核糖体，像tRNA一样识别密码子。 上述只是单个核糖体的翻译过程，事实上在细胞内一条mRNA链上结合着多个核糖体，甚至可多到几百个。蛋白质开始合成时，第一个核糖体在mRNA的起始部位结合，引入第一个甲硫氨酸，然后核糖体向mRNA的3′-端移动一定距离后，第二个核糖体又在mRNA的起始部位结合，向前移动一定的距离后，在起始部位又结合第三个核糖体。两个核糖体之间有一定的长度间隔，每个核糖体都独立完成一条多肽链的合成，所以这种多核糖体可以在一条mRNA链上同时合成多条相同的多肽链，这就大大提高了翻译的效率。多聚核糖体的核糖体个数，与模板mRNA的长度有关，例如血红蛋白的多肽链mNRA编码区有450个核苷酸组成，长约150nm，上面串连有5～6个核糖体形成多核糖体。而肌球蛋白的mRNA由5400个核苷酸组成，可结合50～60个核糖体（图9-15）。 * * 9.6 真核生物的蛋白质合成 9.6.1 真核生物肽链合成的起始 真核生物蛋白质生物合成的起始机制与原核生物基本相同，但是也存在一些差异：① 蛋白质合成的起始于甲硫氨酸，而不是原核的甲酰-甲硫氨酸。一般把真核起始的非甲酰化的甲硫氨酸写为tRNAiMet。与原核生物相比，真核生物特异的起始tRNA不需要N端甲酰化。② 真核生物mRNA没有SD序列，不以SD序列特征来显示核糖体应该在什么位置开始翻译。另外，由于这两个明显的区别，真核细胞蛋白质合成起始机制不同于原核生物，对起始因子的要求也不同。 * 辅因子 活性 eIF1 与mRNA结合形成40S前起始复合物 eIF1A 稳定Met-tRNAi与40S核糖体的结合 eIF2 为小分子G蛋白，依赖于GTP促进Met-tRNAiMet 结合到40S上 eIF2B 促进eIF2·GDP与细胞质中GTP的交换 eIF3 促进80S核糖体的解离及Met-tRNAi和mRNA与40S亚基的结合 eIF4A 用依赖于RNA的ATP酶和解链酶的活性破坏mRNA的二级结构，促进mRNA结合到43S复合物 eIF4B 与mRNA结合，促进RNA解链酶活性和mRNA与40S亚基的结合 eIF4E 帽子结合蛋白，为eIF4F复合物的一部分 eIF4G 为eIF4F（旧称 CBPII）复合物的一部分，可同时与eIF4E和PABP结合 eIF5 促进其他起始因子与40S亚基解离，促进eIF2的GTP酶活性，使 40S和60S亚基形成80S起始复合物 eEF1 一种小分子G蛋白，可结合氨酰tRNA，促进其进入核糖体的A位 eEF2 一种小分子G蛋白，促进移位 eEF3 只存在于真菌，提高翻译的忠实性 eRF1/eRF3 两者形成二聚体，eRF1识别三个终止密码子，eRF3是一种小分子G蛋白 PABP 结合多聚polyA尾巴，与eIF-4G相互作用 表9-9 参与真核生物翻译的起始因子、延伸因子和终止因子 * 真核生物mRNA分子的5端有m7GpppNp的帽子结构，它不仅保护mRNA免遭5-外切核酸酶的降解和为mRNA的核运输提供运转信号，而且能提高翻译模板的稳定性和翻译效率。对于通过滑动搜索起始的转录过程来说，mRNA的翻译活性依赖于5-端的帽子结构。绝大多数真核生物mRNA具有起始密码子AUG。但也有5%～10%不是AUG的例外情况。核糖体想要正确识别起始密码子AUG，依赖于起始密码子AUG上下游序列的一个共同序列（consensus sequence）5-CCRCCAUGC-3（R代表A或G）和有关的蛋白质因子。