植物响应病原真菌的代谢组学研究进展-中国细胞生物学学报.PDF

中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2016, 38(4): 434–440 DOI: 10.11844/cj cb.2016.04.0378 植物响应病原真菌的代谢组学研究进展 张凡忠 刘小红 章初龙 林福呈* (浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所, 杭州310058) 摘要 代谢组学是对特定条件下的生物体内代谢物进行定性或定量分析, 从而得到与特定 生理或病理反应相关的代谢物变化的一门新学科, 并因此被广泛应用于植物学、微生物学、毒理 学及疾病诊断等领域。近年来, 代谢组学开始应用到植物–微生物互作研究领域, 尤其是在植物响 应病原菌胁迫的研究中。该文综述了代谢组学的定义、研究方法及其在植物– 病原真菌互作领域 中的应用, 并讨论了其研究前景和所面临的挑战。 关键词 代谢组学; 植物–病原体互作; 生物标记; 数据挖掘 Progresses of Metabolomics in Plants Response to Plant Pathogenic Fungi Zhang Fanzhong, Liu Xiaohong, Zhang Chulong, Lin Fucheng* (Institute of Biotechnology, College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) Abstract Metabolomics is a powerful approach for monitoring metabolic effects in a particular situation by quantitative and qualitative analyses of metabolites in vivo. It has been applied in many fields, such as botany, microbiology, toxicology and disease diagnosis. Recently, this approach has been used in the research of interaction of plant and microbe, especially in the area of responses to pathogen stress. In this review, we focus on methods and applications of metabolomics in the interaction between plants and pathogenic fungi. In addition, we try to discuss the prospects and challenges of metabolomics in the future. Keywords metabolomics; interaction between plants and pathogens; biomarkers; data mining “代谢组(metabolome)”一词是由Oliver等[1]在 为是metabonomics的子集, 但目前对这两个词的使 1998年首次使用的, 用于描述一个生物体合成的所 用并没有严格的界定, 因此常互换使用[4-5] 。 有代谢物。基于metabolome, Fiehn[2]在200 1年提出 代谢组学是系统生物学中非常重要的一个环 “ ” “ 节, 与基因组学、转录组学、蛋白质组学共同构成 了 代谢组学(metabolomics) , 并定义为 对一个生 物体系中所有的代谢物进行定性和定量的综合分 系统生物学研究的主要内容。由于基因或蛋白质的 ” “